小儿门静脉海绵样变手术的风险是比较大的。
如果小儿出现门静脉高压或继发食管胃底静脉曲张破裂出血等现象时，通常需要配合医生采取门静脉海绵样变手术。通过手术可以分流降低门静脉的压力，控制消化道出血现象，但在进行手术的过程中会减少肝部的血流情况，还有可能会引发肝性脑病的发生。此外，在进行手术的过程中，可能需要完全切除静脉曲张，断裂的静脉受到压力差改变的因素影响时，也可能会对肝性交通的静脉造成破坏。
随着医疗水平逐渐的发展，大多数的小儿在进行手术后可以取得较好的治疗效果，术中以及术后发生风险的几率有所降低。
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