胚胎移植不会发生免疫排斥是因为胎盘屏障阻止了免疫细胞与胚胎的接触，使胚胎处于免疫豁免部位。

胚胎植入人体后，不会直接与母体发生物质交换，所有血、氧、二氧化碳、营养成分、激素、代谢废物的交互，均通过胎盘进行。胎盘由母体、胎儿共同提供组织构成，自身不会诱发免疫排斥，且具有胎盘屏障，可以隔离胎盘与子宫的直接接触。

免疫反应的发生，需要免疫细胞与外来抗原接触。在胚胎移植过程中，胎儿可作为外来抗原。胎盘屏障可以阻止免疫细胞与胚胎接触，使子宫与胎盘形成一个免疫豁免部位。胚胎被植入免疫豁免部位时，不会发生免疫排斥。

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