甲状腺疾病可按甲状腺疾病根据其病变性质可分为四大类。
1）单纯性甲状腺肿：包括地方性甲状腺肿、散发性甲状腺肿和高碘性甲状腺肿。
2）甲状腺炎：包括急性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎、无痛性甲状腺炎、慢性淋巴细胞性甲状腺炎和侵袭性纤维性甲状腺炎。
3）甲状腺肿瘤：可分为甲状腺良性肿瘤和恶性肿瘤，良性肿瘤有甲状腺腺瘤、血管瘤、纤维瘤等；恶性肿瘤有乳头状腺癌、滤泡状腺癌、未分化癌、髓样癌、鳞状细胞癌、血管肉瘤和纤维肉瘤等。临床上甲状腺肿瘤往往仅表现为甲状腺结节，因此常把甲状腺肿瘤与甲状腺结节相互混用。实际上结节仅是形态的描述，它包括肿瘤、囊肿、正常组织增生形成成的团块以及其他疾病所引起的甲状腺肿块。手术证明单个结节者约80％为良性肿瘤，
20％为恶性肿瘤。
4）甲状腺发育异常：常见疾病有甲状舌管囊肿或瘘和异位甲状腺甲状腺功能情况分为二大类。
包括甲状腺功能亢进和甲状腺功能减退。

甲状腺结核临床表现缺乏特异性，加之既往无结核病史，故在未获得病理诊断前，不容易确诊。临床上需要与之鉴别的甲状腺疾病有：亚急性甲状腺炎 本病好发于女性，是病毒感染后引起甲状腺滤泡破裂，胶质溢出造成，病程较长。核素扫描可显示冷结节，难与甲状腺结核鉴别。用甲状腺素或左甲状腺素治疗后症状可缓解，且有自愈的倾向;慢性甲状腺炎 主要是淋巴性甲状腺炎和侵袭性纤维性甲状腺炎，特别是后者可表现硬实的甲状腺结节，不易与增生型甲状腺结核鉴别;甲状腺腺瘤或甲状腺癌 甲状腺癌转移到颈淋巴结而误诊为淋巴结核并不少见。相反，亦有颈淋巴结核与甲状腺癌同时发生，也有些甲状腺结核合并颈淋巴结核，而被误诊为癌肿，Rankin分析21例误诊的甲状腺结核时发现，12例误诊为毒性弥漫性甲状腺，4例误诊为甲状腺腺瘤，4例误诊为慢性甲状腺炎，1例误诊为甲状腺囊肿并出血。高方报道的6例甲状腺结核均在手术前皆被误诊，其中误诊为甲状腺瘤4例，甲状腺癌1例，急性化脓性甲状腺炎1例。

反应：甲状腺素检查，通常是检查血液中的甲状腺素、促甲状腺激素、甲状腺疾病相关抗原检查。一份完整的甲状腺素报告主要有八项，包括促甲状腺激素、三碘甲状腺原氨酸四碘甲状腺原氨酸游离三碘甲状腺原氨酸游离甲状腺素，也称为五项甲状腺功能，这五项反映为甲状腺功能亢进或甲状腺功能减退。剩下的三个项目是甲状腺相关抗原，包括甲状腺球蛋白抗原抗甲状腺过氧化物酶抗原促甲状腺激素受体抗原。这三种抗原适用于区分哪种疾病导致甲状腺机能亢进或甲状腺机能减退。