CT结肠成像的并发症包括与患者准备相关的并发症和结肠穿孔。CT结肠成像还导致患者暴露于电离辐射，并且重复检查导致少量但有临床意义的累积辐射暴露，伴有癌症风险。虽然CT结肠成像可以识别重要的结肠外疾病，但在大多数病例中，这会导致对偶然发现进行不必要的评估。
CT结肠成像可能会出现哪些并发症？
一、制剂不良反应
所有的肠道准备制剂均可引起不良反应，包括水和电解质紊乱、恶心、呕吐，腹胀、腹部不适、误吸和呕吐导致的食管裂伤。
二、结肠穿孔
与结肠镜检查相比，CT结肠成像导致结肠穿孔的风险较低。接受CT结肠成像检查以评估症状或进行CRC筛查，一万人中会发生几十例穿孔。与结肠穿孔有关的潜在因素包括使用直肠球囊进行扩张、硬质的直肠导管及手动注入空气，患者因素包括活动期炎症性肠病、先前结肠手术、近期结肠深凿活检、腹股沟疝和梗阻性CRC。
三、辐射暴露
CT结肠成像术使患者暴露于电离辐射，重复检查导致少量但有临床意义的累积辐射暴露，伴有癌症风险。
四、偶然发现的结肠外病变
虽然CT结肠成像可以识别重要的结肠外疾病，但在大多数病例中，这会导致对偶然发现进行不必要的评估。结肠外病变的发生率随年龄增长显着增加。在大约10%的患者中，额外评估了可能重要的结肠外发现。CT结肠成像中约2%-5%的发现最终被证实是重要的。包括腹主动脉瘤、肾上腺肿物、非恶性肾肿物，并在0.5%的病例中发现结肠外癌症。在CT结肠成像检查中检测到的结肠外癌症中，肾细胞癌、肺癌和淋巴瘤是最常见的，并且在诊断时通常是局限性的。然而，目前还不知道发现这些恶性肿瘤能否改善患者的预后。
五、其他并发症
由于不需要镇静，CT结肠成像的患者很少发生心血管并发症。然而，由于结肠扩张可引起疼痛，可能发生血管迷走神经性反应，包括血管迷走神经性反应发作和心绞痛发作。CT结肠成像没有需要入院的心脏并发症，也没有死亡的患者。
CT结肠成像的相对禁忌证包括活动性结肠炎症，例如急性腹泻、活动期炎症性肠病，有症状的结肠腹壁疝、近期急性憩室炎、近期结直肠手术、近期息肉切除术或者黏膜切除术、已知或疑似结肠穿孔、有症状的或高度肠梗阻等等。
