体积较大的肾结石会导致一系列其他身体部位的并发症，并且根本无法用保守措施治疗，或者因为它们太大而无法通过尿液等方法自行排除，或者因为它们导致出血，肾损伤或正在进行的尿路感染 ，因此体积大的肾结石需要更加广泛的进一步治疗。
大肾结石的治疗方法有哪些呢？
一、声波击破：根据结石的大小和位置 ，建议患者采用一种称为体外冲击波碎石（ESWL）的程序。ESWL使用声波产生冲击波，将石头分解成可以通过尿液的小块。该过程持续约45至60分钟，并可能导致中度疼痛，因此患者可能需要镇静或轻度麻醉以使患者感觉舒适。ESWL可引起尿液中的血液，背部或腹部的瘀伤，肾脏和其他邻近器官周围的出血以及石块通过尿道时的不适。
二、手术去除：对于肾脏中非常大的结石，一般采用称为经皮肾镜取石术的手术，包括使用小型望远镜和通过背部小切口插入的器械手术切除肾结石。在手术过程中患者将接受全身麻醉，并在患者恢复期间在医院中接受一至两天的麻醉。如果ESWL不成功，建议患者采用这种手术。
三、确定范围：要去除输尿管或肾脏中较小的石块，医生可能会将配有照相机的薄壁发光管（输尿管镜）穿过尿道和膀胱输送至输尿管。一旦石头被找到，特殊的工具就可以将石头圈套起来，或者将它们分解成可以通过尿液的碎片。医生可能会在输尿管内放置一个支架以缓解肿胀并促进愈合。在此过程中，患者可能需要全身或局部麻醉。
四、甲状旁腺手术：一些磷酸钙结石是由过度活跃的甲状旁腺引起的，它位于甲状腺的四个角落，就在患者亚当苹果的下面。当这些腺体产生过多的甲状旁腺激素，也就是俗称的甲状旁腺功能亢进症，患者的钙水平可能会变得过高，因此可能会形成肾结石。甲状旁腺功能亢进有时会发生在一个小的良性肿瘤形成于患者的甲状旁腺，或者患者发展出另一种导致这些腺体产生更多甲状旁腺激素的疾病。去除腺体的生长阻止了肾结石的形成。或者患者的医生可能会建议治疗导致患者的甲状旁腺过度激素的病症。
除了上述的几种对于体积较大的肾结石的治疗方法以外，还有一些更加便捷的针对小型肾结石的治疗方法，大肾结石的治疗方法优点在于结石去除更加干净彻底，治疗预后效果较好且不容易产生复发。