儿童自闭症是一种严重的疾病，它在出现了后，我们也要进行合理的治疗，特别是在进行药物治疗的时候，也要注意一些事情。
儿童自闭症治疗药物
1、精神病药物
Haloperidol （Haldol）曾经用来消除攻击、过动及同一性的行为，同时可以增加注意力，其副作用是患者会有脸部、下巴、下颚及上肢，会有不自主的抽动，但一旦停药，则副作用自然消失。
抗忧郁症药物曾用来消除自闭儿的强迫症及固着行为；锂盐是躁郁症的治疗药物，也用来治疗出现周期躁郁症及攻击行为的自闭儿；心理刺激物（如利他宁或安非他命）有时用来减少过动。
2、生化治疗
① Fenfluramine 用来降低自闭儿过高的血清素，血清素是神经的传递物质。此药物的疗效仍然未经证实。有研究发现：fenfluramine治疗引起无数问题而必须终止药物治疗，特别是对药物的容受性、食欲及体重问题。
② 肠促胰激素（secretin）是一种神经传导物质，可以有效改善自闭儿的语文、说话、眼神接触、睡眠、注意力、稳定情绪、减少自伤行为及过动行为。 Finkelstein（1999）文中指出：在1996年有一篇报导一个自闭儿在使用 Secretin之后，开始说话及眼神接触，燃起父母的希望。
3、B6治疗
目前的研究结果显示：B6的效益是眼神接触较好，较少自我刺激的行为，对旁边的事物较有兴趣，较少发脾气，更多语言。单独服用巨量 B6会引起四肢麻痺，加上镁一起服用，便可预防。
4、叶酸
叶酸是维他命 B 中的一个重要成员。在身体内参加细胞中DNA（脱氧核糖核酸）RNA（核糖核酸）的合成。自闭儿服用叶酸的结果：46﹪有显著的效果，它可帮助语言、情绪安定（抗忧郁及焦虑）、改善睡眠的不安。
5、DMG
DMG（Dimethylglycine）是一种健康食品，不具毒性，也没有显著的副作用，可在食品店中买到。DMG 的药效包括减少癫痫的发生，降低强迫行为及改善语言。部分儿童服用 DMG 后有过动的现象，如果此现象发生时，可服用 1600mcg 的叶酸以抵销副作用。
儿童自闭症用药原则
1、药物治疗必须建立在正确的诊断上，有些自闭儿伴随有神经病患（如妥瑞士症），药物的选择必须根据特定的神经病理。
2、严重行为问题或情绪障碍的患者，且对其他形式的治疗没有反应者，才考虑用药。
3、不管年龄大小及功能的等级（高、中、低功能），自闭儿本身应参与与治疗的过程。尽量帮助他们了解用药的目的和理由。这样可避免他们对用药产生负面的态度和误解。例如有些过动儿会因为吃药而不过动，若一天不吃药就过动，因为他相信过动是生理的必须服药才能控制。
4、自闭儿的照顾者（家长或老师保育人员）应纳入治疗程序。他们可提供自闭儿功能及对药物反应的信息，供医师用药的参考，所以他们要被告知药物治疗的原因、可能的药效及副作用。
5、药物的安慰剂效果要注意，所谓安慰剂的效果是指医师父母或其他照顾者都可能因为期望而看到药物的疗效。
儿童自闭症注意事项
1、创造欢愉的家庭气氛：幼儿期的生活环境对性格的形成和发展有着重要的作用。父母间的亲密和谐会使孩子感到温馨和愉悦。相反，父母的不和与争吵会使孩子在心理上产生压力，久而久之会影响身心健康。
2、培养广泛的兴趣：父母应引导孩子发展多种多样的兴趣，听故事、做游戏、画画、唱歌跳舞等，父母尽量参与其中，这不仅可以开发孩子的心智，而且可以加强父母与孩子间的感情交流。
3、让孩子多结交小朋友：对儿童来说，交朋友是一件快活自在的事，能联络感情、增长见识、提高应变和活动能力。另外，儿童有类同的思维和爱好，他们之间有一种天然的吸引力，在群体中相处，有助于身心健康，避免性格孤僻。
4、增加新鲜刺激：每一种声音和色彩对儿童都是一种诱惑，他们的感官和眼睛需要新鲜东西的刺激。父母应经常带孩子外出，让他们融入大自然，开阔胸襟。
5、树立榜样：让孩子走出自闭症作为父母应该表现得坚定自信，切不可精神沮丧和怨天尤人，因为父母是孩子心目中力量和智慧的化身。当孩子胆怯和失望的时候，父母要及时帮助。使其树立信心，战胜困难。