慢性肾盂肾炎半数以上患者有“急性肾盂肾炎”既往史，实际上不是急性肾盂肾炎，而是慢性肾盂肾炎的首发症状，其后有乏力，间歇性低热，厌食，腰酸，腰痛，季肋部或腹部轻度不适等症状，并伴有尿频，尿急，尿痛等下尿路刺激症状，急性发作表现也时有出现，典型的慢性病变其过程则更为隐匿。因此一定要做好诊断，必要时辅以检查来确定此病，以免延误治疗。
一、实验室检查
1、尿常规：可有间断性脓尿或血尿，急性发作时与急性肾盂肾炎的表现相同。
2、尿细胞计数：近年多应用1h尿细胞计数法，其评判标准：白细胞>30万/h为阳性，<20万/h为阴性，20万～30万/h需结合临床判断。
3、尿细菌学检查：可间歇出现真性细菌尿，急性发作时，与急性肾盂肾炎相同，尿培养多为阳性。
4、血常规：红细胞计数和血红蛋白可轻度降低，急性发作时白细胞计数和中性粒细胞比例可增高。
5、肾功能检查：可出现持续肾功能损害：①肾浓缩功能减退，如夜尿量增多，晨尿渗透压降低；②酸化功能减退，如晨尿pH增高，尿HCO3-增多，尿NH4 减少等；③肾小球滤过功能减退，如内生肌酐清除率降低，血尿素氮，肌酐增高等。
二、影像学检查
1、X线检查：KUB平片可显示一侧或双侧肾脏较正常为小，IVU可见两肾大小不等，外形凹凸不平，肾盏，肾盂可变形，有扩张，积水现象，肾实质变薄，有局灶的，粗糙的皮质瘢痕，伴有邻近肾小盏变钝或呈鼓槌状变形，有时显影较差，输尿管扩张，膀胱排尿性造影部分患者有膀胱输尿管反流，此外还可发现有尿流不畅，尿路梗阻如结石，肿瘤或先天性畸形等易感因素。
2、放射性核素扫描：可确定患者肾功能损害，显示患肾较小，动态扫描还可查出膀胱输尿管反流。膀胱镜检查可能发现在患侧输尿管口有炎症改变，输尿管插管受阻，静脉注射靛胭脂证实患肾功能减弱。
3、肾活检：光镜检查可见肾小管萎缩及瘢痕形成，间质可有淋巴细胞，单核细胞浸润，急性发作时可有中性粒细胞浸润，肾小球可正常或轻度小球周围纤维化，如有长期高血压，则可见肾小球毛细血管壁硬化，肾小球囊内胶原沉着。