尖锐湿疣的治疗过程首先要去除疣体，预防感染，适当的进行抗病毒、增强免疫的治疗。另外，尖锐湿疣是个易传染、易复发的疾病，对于它的治疗还没有一个比较确切的治疗方案，所以治疗后应该观察6个月。6个月内要一周自检两次，发现可疑，立即就医，把疣体消灭在萌芽状态，不让它继续感染周围粘膜或皮肤，直到最后没有复发为止。

建议采用微波手术治疗尖锐湿疣，利多卡因局麻，将杆状辐射探头尖端插入尖锐湿直达疣体基底，当看到就体变小、颜色变暗、由软变硬时，则热辐射凝固完成，即可抽出探头。凝固的病灶可以用镊子挟除。为防止复发，可对残存的基底部重复凝固一次。

尖锐湿疣在目前的医学技术下是可以根治的。一般的患者在尖锐湿疣常规治疗后3个月容易出现复发，主要是因为早前常用的物理方法：像激光、手术、药物单纯的治疗表明症状，快速满足症状消失心理安慰的同时，病毒残留，就会在一定时期在原病灶或周边区域复发，所以该病的治疗要结合病情病毒定量检查结果明确治疗，保证病毒的彻底清除，平时要注意禁止性生活，以免发生交叉感染患病。