肝硬化结节：肝硬化结节是最极易被误诊率为肝癌的病理变化之一。由于大多数原发性肝癌都是在肝硬化的基础上产生的，而肝硬化较重的肿瘤患者，其肝本质会呈现大批的增生结节。而这种结节与早期的肝 癌在临床影像学上是较难区别的，同时这两种病的肿瘤患者又都可伴有甲胎蛋白的升高。从组织学上看，肝硬化结节可分为通常增生性结节、不典范增生性结节和未分化结节，其中只有未分化结节从病理病因学上看是属于癌前病理变化。然而，未分化结节的肝硬化若发展到肝癌则需求数月至数年不等的时间。
肝血管瘤：肝血管瘤和肝癌都是血管较为丰富的占位性病理变化，经彩色多普勒超声临床诊断检查诊断仪和CT加强扫描临床诊断检查，两者都会显示丰富的血流危险信号。因此二者极易混杂。但肝血管瘤通常生长缓慢，病程较长。该病肿瘤患者过往通常没有慢发性肝病病史，也没有乏力、纳差、腹胀等症状，更不会呈现肝掌、蜘蛛痣、黄疸、双下肢水肿等体症。
非均匀性脂肪肝：脂肪肝肿瘤患者的肝脏大多在超声影像下会显示前强后衰的亮肝现象。而部分该病肿瘤患者的肝本质内则可浮现不均质的脂肪堆积现象，在CT扫描影像中其值较低，有时难以与肝癌区离开。但这种脂肪肝（非均匀性脂肪肝）肿瘤患者在临床诊断上不会有肝癌肿瘤患者的全身临床诊断表现，如腹胀、腹泻、右侧肝区不适、消瘦等，也不会伴有甲胎蛋白（AFP）和γ-谷氨酰转肽酶（GGT）增高级现象。
肝肉芽肿：某些妇科肿瘤患者由于口服避孕药，或受到寄生虫沾染，或自身免疫功效产生混乱等原因，其肝脏会呈现一个孤立、光滑、完整的结节。这种结节在临床影像学上有时难以与肝癌相距别。
肝脓肿：肝脓肿是机体某一部位受到沾染后，通过血源性播散而在肝脏产生的病理变化，肿瘤患者有乏力、纳差、低热、消瘦、肝区不适等临床诊断临床诊断表现。肝脓肿在超声影像下显示为低回声光点，在病理变化初期或脓肿较小的情况下是难以与肝癌相距别的。
肝内钙化灶：有些人在受到结核杆菌、寄生虫或特异性微生物的沾染后，虽经治疗可以痊愈，但痊愈后在其肝脏上会变成钙化灶。这种钙化灶在超声影像下可显示强回声光点，极易与肝癌相混杂。
