小肠肿瘤无特有的临床症状，早期确诊较难，在出现并发症前往往易被忽略。按其症状出现频率依次为：腹痛、腹部肿块、出血、梗阻和穿孔。
1、腹痛 是最常见的症状，70%的病例均表现有不同程度的腹痛。早期多因肿瘤引起肠蠕动紊乱或牵拉肠系膜所致，疼痛部位与肿瘤位置相应。一般为脐周隐痛、胀痛、进食后加重，不引起病人重视。若并发生梗阻或穿孔时，腹痛加重，病人常因此就诊。
2、腹部肿块 近半数病例于腹部可触及肿块，空肠肿瘤常在左上腹部可触及肿块，回肠肿瘤的肿块则多在下部腹或右下腹部可触及。肠外生性肿瘤多数体积大，良性肿瘤表面平滑、边界清楚、活动度较大。恶性肿瘤多数边界不清、表面不平滑、硬、动度较小。若肿块时隐时现，出现时伴有腹部阵发性疼痛，在成年人应考虑为肿瘤引起肠套叠。
3、消化道出血 多为长期便潜血阳性导致贫血，偶有便鲜血或大量新鲜血便，甚至发生休克。大量出血时，先伴阵发性腹痛、肠鸣，继之排新鲜血便。肿瘤所在位置及出血量不同，大便可呈咖啡色、棕红色、酱红色至鲜红色，如在回肠末端肿瘤大量出血，则血色鲜红，近端空肠可出现呕血及柏油样便。平滑肌肿瘤、血管瘤和恶性淋巴瘤的出血率高。腔外型平滑肌肿瘤偶可破溃造成腹腔内出血。
4、肠梗阻 为肠腔狭窄、堵塞引起，亦可因肠套叠、肠腔受压或肠管扭转所致。其发生与肿瘤生长方式有关，其生长方式有：
①向肠腔内生长：小的息肉样肿瘤如小肠腺瘤、脂肪瘤、纤维瘤等，多诱发肠套叠，出现阵发性腹痛、呕吐、腹部触及包块，包块消失后则症状缓解，上述症状反复出现。大的肿瘤常阻塞肠腔，出现慢性不全肠梗阻或急性肠梗阻症状，由于腹胀，腹部肿块往往不易被触及。
②沿肠壁浸润生长：引起肠腔环行狭窄，多发生于腺癌，病程进展较快。③向肠壁外生长：此类型肿瘤多在较大时始出现症状，引起小肠折叠、扭转，或肿瘤与大网粘连压迫肠管，或侵犯周围肠管引起肠腔狭窄、梗阻，多见于小肠恶性淋巴瘤。腺癌、淋巴肉瘤较早出现肠梗阻。
临床表现随梗阻部位不同而异。高位小肠梗阻可表现为上腹不适或疼痛、嗳气、恶心呕吐等；低位小肠梗阻可表现为脐周疼痛、痉挛性绞痛、腹胀、呕吐等。检查有腹部膨隆，少数有肠型出现，听诊肠鸣音呈阵发性亢进或气过水声，触诊有部分可触及肿块。
5、肠穿孔 发生于晚期病例，以平滑肌肉瘤和恶性淋巴瘤居多。因肿瘤破溃引起急性穿孔，出现急性腹膜炎症状。若破溃前已被大网膜或周围肠管包裹，穿孔后形成腹腔脓肿，病人先有持续腹痛、腹胀等消化道症状，伴发热腹部痛性肿块，消炎治疗症状稍减轻，但不能完全消退。脓肿穿破至游离腹腔，则出现弥漫性腹膜炎；穿破至邻近肠管发生肠内瘘，出现腹泻、排脓血便后，腹部症状和体征减轻；穿破至膀胱、子宫，出现小肠膀胱瘘和小肠子宫瘘的症状。
6、其他症状 有贫血、体重下降、腹泻、发热等，多见于小肠恶性肿瘤。小肠类癌发生肝转移者，出现类癌综合征的临床表现。