尿道肉阜通常采取药物或是手术的方法治疗，还可选择物理疗法治疗，需要根据症状严重程度制定合适的治疗方法。对于没有任何明显症状者，可无需特殊治疗。若是有症状出现，可先口服雌激素类药物或外用雌激素栓剂治疗。还可通过电灼、电切等物理疗法治疗。若是肉阜较大，还需应用手术环切。

治疗尿道肉阜的方法通常是：如果没有明显的尿道肉阜，如果是轻微的，可以采取女性阴道栓，每晚一次，也可以配合刺激素软膏，如果是慢性发作，或长期发作，或激光手术。尿道肉阜的患者可以及时去正规医院，在医生的指导下补充体内雌激素来改变情况。必要时，也可以通过电灼、冷藏、激光或手术切除来改变情况并恢复生活。

尿道肉阜的治疗主要取决于病情轻重，如果没有其它不适临床表现，往往不需要特殊干预治疗。必要时可以采取雌激素药物局部治疗，有抑制尿道肉阜的生长作用。严重的则可以通过液氮冷冻术或者激光手术打掉病变组织即可。患者要注意阴部卫生，避免外力摩擦刺激患处。