男性性功能障碍的内分泌治疗，主要指对睾酮和绒毛膜促性素的应用，早在本世纪初，睾酮曾被作为返老还童的药物，风靡于世，当时被命名为“男性荷尔蒙”，有“强身”之功。今天这一认识早已被纠正。睾酮的作用，已在生殖器官的组成与功能一节中述及，此处不再赘述。
在男性性功能障碍的治疗中，仍应用较多。从理论上说，此药对男性雄性激素不足的性功能障碍病人应该是有效的，许多病人也反映了它的主观疗效，但有的学者认为：对非雄性激素不足的病人来说，本药仅起着精神治疗的作用，可能短期内有效。这里牵涉到病例的选择问题。
鉴于这类病人性内分泌的潜在低下（即性内分泌储备功能受损）是相当普遍的，所以，实际上本药的适应范围比想像的要广，凡疑为性内分泌不足的病人都可试用，但不宜长期应用，一般以1~2周即可。根本的办法在于恢复睾丸间质细胞的功能，或腺垂体促性腺激素的功能，否则，药物有作用毕竟是暂时的。用法为每天肌内注射丙酸睾酮25毫克，应用2周，或每天50毫克，应用1周。如口服甲睾酮，由于它被吸收后迅速在肝脏代谢，致血中药物的半衰期很短，故可将药物含于舌下，使部分药物被口腔黏膜吸收而直接进入体循环，临床观察认为这种方法也是可取的。用法为每天2次，每次10毫克。
应该指出：目前滥用男性激素的现象比较普遍，在基层尤为严重，主要表现在长期连续使用。必须认识到长期滥用睾酮可产生严重的损害作用。长期的血液高睾酮水平，使腺垂体促性腺激素的分泌减少，可导致睾丸的萎缩。大量的实验资料证明：每天注射丙酸睾酮25毫克，连续2~3个月，可产生精子缺乏症；大量服用睾酮，可玫红细胞总数增加，钠和水潴留；此外，睾酮可使血清β-脂蛋白增加、α-脂蛋白降低，这种变化可能和发生动脉粥样硬化有关；在个别情况下，应用睾酮后还可使血清胆固醇增高。此外，还有痤疮、多毛、肥胖以及心脏和肝功能受损等不良反应。动物试验表明：过量的睾酮可引起大鼠高血压。
关于睾酮的一些新合成的衍生物，品种较多，但一般都仅仅试用于男性计划生育范围内。苯丙酸诺龙的蛋白质合成作用虽强，对性功能的作用较差，不宜用于性功能障碍。
腺垂体促性腺激素还不能用于临床。但是，胎盘绒促性素对睾丸的刺激作用，近似于腺垂体促性腺激素。这种激素早已被提纯，来源广阔，并已用于临床，对男子性功能障碍、隐睾症、无睾症等生殖系统疾病，以及妇科功能性出血等疾病，都可能收到一定的疗效。在男子性功能障碍中，城促性素着重应用于垂体促性腺激素分泌不足的病人，每次500~1000单位，每周2次，溶于蒸馏水或生理盐水中行肌内注射。注射前应做皮内试验，以免发生变态反应。一般以20次为1个疗程。临床体会到，此药对头部外伤后引起的性功能障碍效果较为显着，应用3周后可使性功能明显改善或恢复；甚至个别病人中已经萎缩的阴茎和睾丸也能得到再发育。