呕吐是由许多轻重不同的病因所引起的，这与新生儿的解剖生理特点有关，如大脑皮质发育不成熟，对呕吐中枢的控制能力差；食管肌层的弹力纤维发育差，贲门括约肌松弛而幽门括约肌力强；胃容量较小而需要的入量较多；胃黏膜对各种刺激较敏感等，消化道畸形也是引起呕吐的重要原因，应及时明确诊断，常见的病因有：
1、化系统疾病：
各种消化系统疾病都可引起呕吐，主要有消化道先天畸形，梗阻，炎症，感染，出血，功能失调等。
（1）消化系统功能紊乱：
如吞咽功能不协调，胃食管反流，贲门失弛缓症，幽门痉挛，胎粪性便秘，胎粪排出延迟等。
（2）消化道黏膜受刺激：
如咽下综合征，胃出血，应激性溃疡，牛奶过敏等。
（3）消化系统炎症：
如急性胃炎，急性肠炎，坏死性小肠结肠炎，腹膜炎等。
（4）消化道梗阻：
多数为先天畸形所致。
① 上消化道梗阻：
食管气管瘘，食管闭锁，食管裂孔疝，胃扭转，幽门肥厚性狭窄，环状胰腺，先天性膈疝等。
②下消化道梗阻：
如肠旋转不良，小肠重复畸形，肠狭窄，肠闭锁，先天性巨结肠，肛门闭锁等，少见疾病有嵌顿疝，肠套叠等。
2、全身性疾病：
许多全身性疾病可引起呕吐，常见的有以下几方面：
（1）感染：
新生儿感染常引起呕吐，如败血症，呼吸道感染，泌尿系统感染等。
（2）颅内压增高：
引起颅内压增高的疾病会导致呕吐，如中枢神经系统感染，脑水肿，脑积水，颅内出血，颅内肿瘤等。
（3）先天性代谢性疾病：
一些先天性代谢性疾病由于代谢紊乱而导致呕吐，如氨基酸代谢疾病（高氨血症，苯丙酮尿症，甘氨酸血症），糖代谢疾病（半乳糖血症，枫糖尿症），肾上腺皮质增生症等。
3、其他因素：
一些非疾病因素也可引起新生儿呕吐。
（1）喂养不当：
喂养不当是引起新生儿呕吐的常见原因，尤其婴幼儿时期，主要原因有：喂奶次数过于频繁，喂奶量太多，浓度不适合，牛乳太热或太凉，乳方多变；奶嘴孔过大或过小，妈妈乳头下陷；喂奶后平卧，体位多动，由于喂奶过多，或因吞咽过快，吞入空气等，常在喂奶完毕后不久发生吐奶。
（2）药物：
许多药物可引起消化道反应，发生呕吐，如红霉素，两性霉素B等。