花椒籽呈圆球形、椭圆形或半圆形，直径约3～5mm，表面黑色，有光泽，有时表皮已脱落，露出网状纹理，皮质硬脆，易剥落，除去种皮后可见淡黄白色胚乳及肥厚的子叶，胚根大，胚芽明显。气香，味辛辣。中医学称之为椒目。椒目苦辛，寒，有小毒。归脾、肺、膀胱经。可利水消肿，祛痰平喘。用于水肿胀满，哮喘。花椒籽油对于高血脂人群有很大作用，因α—亚麻酸能明显有效地降低血清胆固醇含量，调节人体血脂平衡，防止发生高血脂，能有效阻断心血管疾病的诱发因素 花椒籽治中寒腹痛，寒湿吐泻。本品辛散温燥，有温中燥湿、散寒止痛、止呕止泻的作用。治外寒内侵，胃寒腹痛、呕吐时，可与生姜、白豆蔻等同用。治脾胃虚寒，脘腹冷痛、呕吐、不思饮食时，常与干姜、人参等同用，如大建中汤。治寒湿困中，腹痛吐泻，多与苍术、砂仁、草豆蔻等同用。 花椒籽有驱蛔杀虫的功效。治虫积腹痛，手足厥逆，烦闷吐蛔，可与乌梅、干姜、黄柏等同用，如乌梅丸。虫积腹痛较轻者，可与乌梅、榧子、使君子等同用。若治小儿蛲虫病，可用本品煎液作保留灌肠。另外，本品有杀虫燥湿止痒的功效，可外用治湿疹瘙痒，妇人阴痒。花椒籽粉碎为四川菜使用最多的调料，常用于配制卤汤、腌制食品或炖制肉类，有去膻增味的作用，亦为“五香粉”原料之一。

α-亚麻酸存在于下列动植物中： （1）猕猴桃籽：猕猴桃籽为猕猴桃加工的副产品,含油量22%～24%,最高可达35.62%,其中α-亚麻酸的含量高达63.99%,其余为油酸,亚油酸,是亚麻酸含量较高的植物之一. （2）蚕蛹：蚕蛹中油脂含量相当丰富,约占蚕蛹干基的25%～29%,其中油脂中α-亚麻酸含量高达30%以上,是非常好的α-亚麻酸生物质来源. （3）椒目：椒目为芸香科植物青椒或花椒的干燥成熟种子.20世纪90年代对花椒子的研究发现其种仁油脂中含α-亚麻酸17%～24%.

川椒健胃、驱蛔虫，并有温暖强壮作用。椒目为利尿药，用于慢性浮肿腹水。古方"己椒苈黄丸"采用椒目作逐水剂。 老人衰弱，病后脾肾阳虚，腰冷脚弱，齿牙浮动：椒红、小茴香等分，微炒后研细末，炼蜜为丸，每服3~6克，一日2次。 肋节风痹，关节肿病，肌肉瘦削，四肢不遂：椒红500克，炒研末，嫩松叶、嫩柏枝各250克，微炒后研末，酒泛为丸，食后服，每服3克，一日2~3次。 慢性萎缩性胃炎，肥厚性胃炎，消化不良，胀闷：椒红(微炒)、干姜、橘皮、甘草等分，研末(或为丸)，食后服，每服3~6克，一日2次。 慢性肾炎或肾病综合征的浮肿腹水：椒目60克，炒后研细，车前子、草劳子等分共研细，枣肉为丸，每服3~6克，一日2次。 蛔虫腹病，或胆道蛔虫，呕吐腹病：川椒6克(微炒)，乌梅9克，水煎，一日2~3次分服。 蛀牙病：川椒9克，烧酒30克，浸泡10天，滤过去渣，用棉球蘸药酒，塞蛀孔内可止痛。 断奶回乳：取花椒6克，加水400毫升，浸泡后煎水煮浓缩成200毫升，再加红糖30－60克，于断乳当天趁热一次饮下，每日1次，约1－3天可回乳。 治痛经：用花椒10克，胡椒3克，二味共研细粉，用白酒调成糊状，敷于脐眼，外用伤湿止痛膏封闭，每日1次，此法最适宜于寒凝气滞之痛经。 治秃顶：适量的花椒浸泡在酒精度数较高的白酒中，1周后使用时，用干净的软布蘸此浸液搽抹头皮，每天数次，若再配以姜汁洗头，效果更好。 治痔疮：花椒1把，装入小布袋中，扎口，用开水沏于盆中，患者先是用热气熏洗患处，待水温降到不烫，再行坐浴。全过程约20分钟，每天早晚各1次。 治膝盖痛：花椒50克压碎，鲜姜10片，葱白6棵切碎，三种混在一起，装在包布内，将药袋上放一热水袋，热敷30至40分钟，每日2次。