流感病毒是一个大家族，它包括人甲、乙、丙型和动物甲、丙型，只有甲型流感病毒可以导致人和禽之间的传播。所谓H7N9禽流感病毒，就是病毒表面的红细胞血凝素和神经氨基酸酶由H7和N9组成，并主要在禽类动物中流行的流感病毒。患者一旦怀疑禽流感病毒感染，应立即住院观察治疗，防止病情恶化，同时进行疫情报告，以防疫情扩散。目前对禽流感尚无特异性治疗方法，从中医和西医的两个治疗方向来说，可以分为以下几种治疗方法。
【西医】
1、对症治疗
（1）可应用解热药、缓解鼻粘膜充血药、止咳祛痰药等。
（2）儿童忌用阿司匹林或含阿司匹林以及其它水杨酸制剂的药物，避免引起儿童Reye综合征。
2、隔离治疗
为了防止病毒进一步传播以及变异，对疑似和确诊患者应进行隔离治疗。
3、抗流感病毒治疗
（1）使用抗病毒治疗的疗效不错，但要达到更好的治疗效晚，要注意，应该是应在发病48小时内试用抗流感病毒药物。
（2）有一种对禽流感病毒H5N1和H9N2有抑制作用的新型抗流感病毒药物是神经氨酸酶抑制剂奥司他韦（Oseltamivir，达菲）。用法是：为新型抗流感病毒药物，试验研究表明对禽流感病毒H5N1和H9N2有抑制作用，
（3）金刚烷胺和金刚乙胺可抑制禽流感病毒株的复制。金刚烷胺成人剂量每日100～200mg，儿童每日5mg/kg，分2次口服，疗程5天。
早期应用可阻止病情发展、减轻病情、改善预后。治疗过程中应注意中枢神经系统和胃肠道副作用。
特别注意的是：肾功能受损者酌减剂量；有癫痫病史者忌用。
2013年4月5日，国家食品药品监督管理总局批准了抗流感新药帕拉米韦氯化钠注射液，现有临床试验数据证明其对甲型和乙型流感有效。H7N9属于甲型流感病毒亚型。
【中医】
中医药治疗参照时行感冒（流感）及风温肺热病进行辨证论治。
中药代茶饮
处方一：适合3至12岁儿童，组成是芦根10g、连翘3g，每日1剂，开水浸泡。
处方二：适合成人，组成是白茅根5g、藿香3g、菊花3g、北沙参5g，每日1剂，开水浸泡。高龄体弱，慢性病气虚人群可加用玉屏风散。
需要提醒的是，学校及幼儿园应采取措施，教导儿童不要喂饲野鸽或其他雀鸟，如接触禽鸟或禽鸟粪便后，要立刻彻底清洗双手。外出在旅途中，尽量避免接触禽鸟，例如不要前往观鸟园、农场、街市或到公园活动；不要喂饲白鸽或野鸟等。