根据病变部位的不同，而出现不同的症状，最常见的症状为痛经、月经失调、性交痛、不孕等。 凡在生育年龄的妇女有进行性加剧的痛经或伴不孕史，妇科检查可扪得盆腔内有不活动包块或痛性结节者，一般即可初步诊断为盆腔子宫内膜异位症。

子宫内膜异位症的临床表现有时与病变程度很不相符，临床表现很严重的患者，其病变可能是轻度的或局限的，而病变广泛甚至盆腔解剖结构严重变形的患者，其临床表现却很少。据统计，约70%的子宫内膜异位症患者有典型的继发痛经、性交不快或性交痛、不育及月经改变。当子宫内膜异位症发生于其它特殊部位时，可出现许多其它令人迷惑的临床表现。而大多数子宫内膜异位症患者的主要症状是继发性痛经，伴下腹部和背部进行性疼痛，常可放射至腿部。疼痛常于月经1-2天开始。相当于异位子宫内膜出血时，月经开始达到最高峰。大多数患者在行经期疼痛可缓解。

影像学检查是临床上诊断子宫内膜异位症最好的方法。如果怀疑女性患有子宫内膜异位症，这个时候可以进行B超检查、腹腔镜检查来帮助确诊病情。子宫内膜异位症的患者临床症状十分明显，患者可能会出现痛经、月经异常等一系列临床表现。一旦女性被诊断为子宫内膜异位症，要积极采取措施进行治疗。