生殖器疱疹的HSV感染的潜伏期为1周至2个月。HSV-1感染首要发生于口角、唇缘、鼻孔等肌肤粘膜交界处，亦可见面子或口唇，开端局部先有灼痒及轻度紧张感，偶有伴发神经痛。随即呈现红斑，在红斑基础上发生簇集性小丘疹，迅速变为粟粒至绿豆巨细的水疱，内容弄清，水疱破裂后呈现溃烂面，数日后枯燥结痂。自觉灼痒，偶有厌倦，不适和轻微发热等全身表现，愈合可留传暂时性色素冷静。全病程1-2周摆布。

HSV-2感染首要发生于生殖器部位，患部先有炙烤感，很快在红斑的基础上发生成群的小水疱，多见男性包皮、龟头、冠状沟、阴茎等处，偶见于尿道；女人常见于阴唇、阴蒂、阴道、宫颈等处。水疱可逐步成为脓疱，约6天摆布破溃而构成溃烂或浅的溃疡，自觉痛苦。患者可发生尿道炎，呈现排尿艰难。多数人有腹股沟淋巴结肿大痛苦，有的患者可呈现发热、肌肉痛及脑膜炎表现。如发于女人宫颈者可构成溃疡坏死，阴道分泌物增多，可有下腹痛。应留意有无宫颈癌发生。孕期患生殖器疱疹时易致流产、早产或死胎，并易使新生儿感染，发生新生儿单纯疱疹。

本病通常通过3周摆布能够康复，但常有重复发生，通常原发疹后2-5个月内复发，表现较原发者轻，规模亦小，局限于生殖器部位，有时仅有1-2个疱疹，病程亦短，自发病至愈合6-10天。本病也可伴有生殖器以外部位的感染，如口唇、臂部及中枢神经系统等。

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