多囊卵巢综合症是以慢性无排卵、闭经或月经稀发、不孕、肥胖、多毛和卵巢多囊性增大为临床特征的综合症候群，其引起不孕的实质是排卵障碍，确切的病因尚不十分清楚，目前多认为多囊卵巢综合症与下丘脑对促性腺激素调节失调、卵巢和肾上腺酶功能异常、高雄激素血症、青春期启动异常、遗传因素等有密切的关系。
其中促性腺激素分泌异常、胰岛素抵抗与高雄激素血症是关键环节。
针对多囊卵巢综合症的这些病因，通过药物调节患者激素分泌，纠正代谢，降低体重，改善症状。不同年龄治疗目的也不一样，对于有生育要求的女性来说恢复排卵是其目的。
对于没有生育要求的女性来说，调整月经，防止子宫内膜疾病（如子宫内膜增生及癌），预防慢性病，降低胆固醇是其主要治疗目的。药物治疗多囊卵巢综合症分为以下几个方面：
1、减肥，同时治疗胰岛素抵抗
对于由肥胖和胰岛素抵抗引起的多囊卵巢综合症，首先就要通过运动减轻体重，纠正由肥胖带来的内分泌代谢紊乱，部分肥胖型多囊卵巢综合症患者即可恢复排卵。有效的降低体重，还可以改善胰岛素敏感性，降低胰岛素水平，减轻胰岛素抵抗和高胰岛素血症。
2、诱导排卵
药物治疗为首选治疗方法，以克罗米芬为主，适当配伍其他药物，对于难治性无排卵患者或者对促排卵药物不敏感患者，采用卵巢打孔方法诱导排卵，使卵巢功能得以恢复，能有正常的排卵、正常的月经。 克罗米芬：多囊卵巢综合症的首选药物，排卵率为60%～80%，妊娠率30%～50%。
调整促性腺激素与卵泡刺激素的分泌比率，也直接促使卵巢合成和分泌雌激素。于自然月经周期或撤药性子宫出血的第5天开始，每天口服50mg，连续5次为1疗程，常于服药的3～10天（平均7天）排卵，多数在3～4个疗程内妊娠。若经3个治疗周期仍无排卵者，可将剂量递增至每天100～150mg。
治疗期间需要记录月经周期的基础体温，监测排卵，以证实有无排卵，指导下次疗程剂量。若经克罗米芬治疗后仍无排卵或受孕，可根据多囊卵巢综合症的病因，适当配合其他药物进行联合治疗，达到排卵的目的，提高排卵率和妊娠率，如绒促性素、糖皮质激素、尿促性素、促性腺激素释放激素、卵泡刺激素、溴隐亭等等。
3、降低雄激素
如果患者雄激素很高，可以先用药物降低雄激素，临床上多采用避孕药，利用避孕药中的孕激素来降低雄激素，治疗同时检测雄激素，个别患者在雄激素降低后即可恢复排卵，对于没有恢复排卵的可再进一步使用促排卵药物诱导排卵。
