一、并发症较多，往往掩盖真凶，治疗南辕北辙。生殖器疱疹本身症状并不可怕，且经过半月左右症状会缓解，但较为可怕的是由疱疹引起的其他并发症，如由此引起的前列腺炎、溃疡、炎症等等 ，在检测的时候往往会误导治疗方向，造成无的放矢。
二、病毒分布较广，光靠药物“鞭长莫及”。疱疹病毒与其他性病不同，疱疹是可以进行全身扩散的病毒，病毒广泛存在于患处、疱疹内部、渗出的组织液中，后期甚至感染神经系统，进入大脑。 病毒的广泛分布使得在治疗的过程中，如果没有一个周全的治疗文案，则无异于“竹篮打水”一无所获。
三、局限治疗，但仍被病毒所包围。疱疹病毒具有极顽强的生存能力，较时间的潜伏期，这两者结合在一起，当一个人产生症状而进行治疗时，必然的病毒已经在你的周边扩散，可能你的妻子、孩 子已经感染，但却仍然不知。如果进行局限治疗，势必治好了又被感染，如此反复。