1、心理负担加重
由于生殖器疱疹的症状一直存在，相信一定会给患者造成一定的心理压力，加上对于生殖器疱疹又没有有效地根治方法，因此常常使患者产生沉重的心理负担。他们害怕疼痛、害怕传染给与其有性关系的人、害怕癌变。原发或复发生生殖器疱疹可伴有排尿困难、急性尿潴留、疱疹性瘭疽、脑炎、子宫内膜炎。
2、症状反复发作
生殖器疱疹虽然症状在一段时间后会自愈，但是患者不进行治疗，疾病就会反复发作，还会有其他症状的出现，可能患者会感觉全身不适、发热、头痛、全身关节和肌肉疼痛。这些症状可持续数天，在此期间或之后，生殖器部位可出现红斑。这些红斑可发展为疼痛性水疱。然后水疱破裂，常常遗留溃疡。后者逐渐结痂愈合，通常不留瘢痕。
3、造成多种并发症
生殖器疱疹的危害是很大的，患者若不及时进行治疗，还会引起其他并发症，可引起播散性疱疹、疱疹性脑膜炎、前列腺炎、男性不育症、脊髓神经根疾病等疾病。在艾滋病流行的地区，该病还可增加艾滋病病毒感染的危险性。另外，生殖器疱疹常与其他性传播疾病，如淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒、尖锐湿疣、念珠菌病、滴虫等混合感染。
生殖器疱疹是如何传播的：
1、性接触传染：这是生殖器疱疹最主要的传播途径。与患有生殖器疱疹的病人或者携带有此病毒的患者性交时，往往是患者早期，其外生殖器部位的疣体很小，不易察觉，此时极易通过性行为传染给对方。一般认为病期在头3个月左右传染力最强。与生殖器疱疹患者有性接触的人，大约2/3可被感染。
2、间接接触传染：在少数情况下，通过接触被污染的物品、公共浴池、桑拿池、浴盆、内裤及毛巾等而被传染。所以要讲究个人卫生，每日清洗外阴、换洗内裤，个人的内裤单独清洗。不使用别人的内衣、泳装、浴盆；公共浴池提倡淋浴，不坐浴池的坐椅；上厕所前用肥皂洗手，公共厕所尽量使用蹲式马桶；为防止家庭内传染，即使家庭成员间也应该做到一人一盆，毛巾分用。对于长时间外出、旅游者对此途径应引起高度重视，奔波在外也要注意个人卫生，勤换内衣内裤、注意宾馆的卫生。
3、母婴传播：胎儿在分娩过程中通过有病毒的产道，或出生后与患生殖器疱疹的母亲密切接触均可感染。主要是由于患有生殖器疱疹的孕妇，尤其是临床症状不明显而子宫颈部位有病毒感染的孕妇，生殖道内会有病毒，在临床的正常分娩时分娩时，胎儿经过产道，导致新生儿的病毒感染，引起婴幼儿患生殖器疱疹。