1、女性不孕 ：卵巢巧克力囊肿导致女性不孕率高达50.9%，结婚多年一直没有怀孕的女性，必须引起高度重视。 在原因不明的不孕症患者中约70-80%的患者伴有子宫内膜异位症，患者常因盆腔器官粘连，使输卵管蠕动受阻或输卵管堵塞等机械因素导致不孕，亦可能为卵巢功能不全，自身免疫反映增强，前列腺素增加，泌乳素增高等因素有关。
2、不正常的痛经 ：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易被忽略的先兆，女性大多以为是正常痛经，不被引起重视。其实这些异位的子宫内膜受激素控制也会发生周期性局部出血，导致周围组织出现炎症，并产生疼痛。 因此，子宫内膜异位症痛经的特点多从月经前甚至周期后半期开始，持续整个月经期至月经后数日消失。疼痛部位多在下腹正中，或偏于一侧，病变浸及子宫直肠。月经过多，月经血量多，也是临床常见症状之一，一般月经周期规律表现为经血过多或带经日久。
3、性交疼痛 ：由于子宫肌肉收缩及盆腔内粘连，子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症均可发生性交痛，而且常于月经前较为明显。在同房过程中，50%以上的女性会有明显疼痛。
4、下腹剧烈疼痛 ：下腹剧烈疼痛占71.3%，尤其是月经到来的头几天疼痛更加厉害，这一症状也是一个明显的信号，需引起女性的足够重视。
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