中医将慢性肠炎辨证分为脾胃虚弱、肝气乘脾、脾肾阳虚和瘀阻肠络四型，分型给予治疗。
1、脾胃虚弱型
症状：大便时溏时泻，迁延反复，完谷不化，纳呆食少，食后不舒，稍进油腻食物，则大便次数明显增多，面色萎黄，神疲倦怠，舌淡苔白，脉细弱。
分析：脾胃虚弱而致泻下，主由脾气虚弱，清阳不升，运化失职所致，故见大便溏泻，完谷不化；脾虚不运，则纳食减少或食后脘闷不适，久泻不止；脾胃气虚，化源不足，致面色萎黄，疲乏倦怠；舌淡苔白，脉细弱，均属脾胃虚弱之象。
治法：健脾益气。
方药：参苓白术散主之。方中人参、白术、茯苓、甘草健脾益气；砂仁、陈皮、桔梗、扁豆、山药、莲子肉、苡仁理气健脾化湿，是治疗脾虚泄泻的常用方药。若脾阳虚衰，阴寒内盛，可配伍附子理中汤，以温中散寒；若久泻不愈，中气下陷，而兼有脱肛者，可投补中益气汤，重用黄芪、党参以益气升清，健脾止泻。
2、肝气乘脾型
症状：素有胸胁胀闷，嗳气食少，每因抑郁恼怒或情绪紧张之时，即腹痛，腹泻，舌淡红，脉弦。
分析：七情所伤，情绪不稳，激怒之时，气机不利，肝失条达，横逆乘脾，失其健运，故腹痛则泻。肝气不舒，疏泄失常，故胸胁胀闷，嗳气食少。舌淡、脉弦，均为肝旺脾虚之象。
治法：抑肝扶脾。
方药：痛泻要方为主。方中白术健脾补虚；白芍养血柔肝；陈皮理气醒脾；防风升清止泻。共奏疏肝解郁，健脾止泻之功。
3、脾肾阳虚型
症状：黎明之前，脐周作痛，肠鸣即泻，泻后则安，形寒肢冷，腰膝酸软，舌淡苔白，脉沉细。
分析：肾阳虚衰，不能温煦脾土，而黎明之前，阳气未振，阴寒较盛，故见脐腹作痛，肠鸣而泻，泻后自安。形寒肢冷，腰膝酸软，舌淡苔白，脉沉细，均属脾肾阳虚不足之征象。
治法：温补脾肾，固涩止泻。
方药：理中汤合四神丸。
肉豆蔻、吴茱萸温中散寒；五味子收敛止泻。配合理中汤温中健脾，主治脾肾虚寒之腹泻。如年老体衰，久泻不止，中气下陷，宜加入益气升阳及收涩之品，如人参、黄芪、诃子肉、石榴皮，赤石脂、炒米壳之类，亦可合用桃花汤以固肠收敛止泻。
4、瘀阻肠络型
症状：泄泻日久，泻后不爽，腹部刺痛，痛有定处，按之痛甚，面色晦滞，口干不欲饮，舌边有瘀斑或舌质暗红，脉弦而涩。
分析：泄泻日久，病邪入络，血瘀肠络，不通则痛，故有腹部刺痛，痛有定处，按之痛甚；瘀阻气滞，故有泻后不尽之感；口干不欲饮，面色晦滞，舌边有瘀斑，舌质暗红，脉弦而涩，均为瘀血内阻之征。
治疗：化瘀通络，和营止血。
方中以蒲黄、五灵脂与当归、川芎配伍为君药，合元胡、没药活血定痛；桂心、小茴香、干姜温经散瘀，使肠络瘀血得散，则泄泻腹痛而止。若气血瘀滞，化为脓血，大便挟有赤白粘冻，可与白头翁汤合用，以清热凉血，利湿解瘀。