1、手术治疗
卵巢囊性肿物直径大于6cm者应手术切除，并按常规送病理检验。因为良性肿物继续生长下去也有恶变的可能。卵巢实性肿物不论大小应尽快手术，术中进行冰冻切片检查，决定手术范围。盆腔肿物诊断不清或保守治疗无效者，应及早做腹腔镜检查或剖腹探查。凡乳腺癌、胃肠癌患者术后应常规妇科检查，并定期随访，以早期发现转移癌。
如果同时伴有进行性加重的痛经及性交痛、盆腔有触痛性结节，则应考虑子宫内膜异位症（即巧克力囊肿）。
2、超声介入治疗
超声引导下介入治疗囊肿，是在超声引导下用较细的进口PTC针穿刺，超声下可看到针尖在囊肿内的位置，囊肿抽吸减压后，囊液不会外溢，囊液抽尽后，注入硬化药物保留10分钟就可将分泌囊液的细胞全部凝固，不再产生囊液，同时将硬化药物再全部抽出，囊内只保留硬化药物，对人体无任何影响。剩下的囊壁组织，在短期内也会完全吸收。穿刺当中不会有出血，也不会损伤其他组织，是一种极安全的治疗方式。治疗过程短，约需10-20分钟整个治疗过程即可完成，不住院，随治随走。3个月后在任何一家医院做一下B超复查，如果囊肿已经完全消失，即达到了完全治愈的标准。对以后生育及卵巢功能无任何影响。
3、腹腔镜治疗
因其具有手术创伤小、出血少、手术时间短、术后恢复快、住院时间短、 腹部几乎不留瘢痕、盆腔粘连少、输卵管阻塞轻微，更易于保留输卵管。组织凝固创面可以防止纤维素的渗出、沉积、明显提高患者手术后的生活质量。
4、中医治疗卵巢囊肿的方剂
海藻12克、白芥子10克、三棱10克、苡仁20克、桃仁10克、夏枯草20克、南星6克、赤芍12克。
功能：理气行滞、活血祛痰、化瘀散结、软坚消肿。
主治：适用各种囊肿，尤其对卵巢囊肿效果显著，对子宫肌瘤、畸胎瘤、肝肾等囊肿也有一定的疗效。
用法：水煎服，药液为 600毫升，每服 300毫升，每日 2次，10天为 1个疗程，1～ 2个疗程B超 1次，如有疗效，服药可直到肿瘤消失为止。用药 3个疗程，肿瘤继续增大者为无效，可做CT检查进一步明确诊断另做治疗。
方解：方中三棱、桃仁、赤芍理气行滞、活血祛瘀，海藻、夏枯草、白芥子能消痰软坚、散结消肿，南星、苡仁化湿祛痰，白芥子与海藻配合能消除黏腻之阴邪，以上诸药配伍，能使痰湿化，气血通，囊肿消也。
