男性不育的病因分类可根据生育能力分为绝对不育（无精子症）和相对不育（精子数量少或精子活力低等），按临床表现可分为原发性不育和继发性不育，按性器官病变部位可分为睾丸前性、睾丸性和睾丸后性。男性不育的原因比较复杂，现就主要原因分述如下：
（一）精液异常
1、无精子或精子过少
精液中精子密度低于0.2亿/ml时女方受孕机会减少，低于0.2亿/ml时，则造成不育。这种不育可分为永久性和暂时性，前者见于先天性睾丸发育障碍或睾丸、精囊严重病变者；后者多见于性生活过频导致生精功能一度衰竭，一般为精子减少而不是全无精子。
2、精子质量差
精液中无活力的或死精子过多（超过20%），或精子活动能力很差或畸形精子超过30%，常可造成不育。
3、精液理化性状异常
正常精液射出后很快凝成胶冻状，在以后的15～30分钟内又全部液化。如果精液射出后不凝固，或液化不全常提示精囊或前列腺有病变。细菌、病毒感染生殖道也可造成精液成分的改变以致引起不育。精液中致病菌大于103个/ml，非致病菌大于104个/ml均可引起不育。
（二）生精障碍
1、睾丸本身疾病
如睾丸肿瘤、睾丸结核、睾丸梅毒、睾丸非特异性炎症、外伤或精索扭转后睾丸萎缩、睾丸缺如等，均可造成生精功能障碍，发生不育。
2、染色体异常
性染色体异常可使睾丸等性器官分化不良，造成真性两性畸形和先天性睾丸发育不全等。常染色体异常可导致性腺及生精细胞代谢紊乱。
3、精子发生功能障碍
长期食用棉子油可影响精子发生精子自身免疫，也可造成精子发生功能障碍。
4、局部病变
如隐性精索静脉曲张、巨大鞘膜积液等疾病影响了睾丸局部的外环境，或因温度、压迫等原因造成不育。
（三）精子、卵子结合障碍
1、精道梗阻
如先天性输精管道的缺如闭锁等畸形，手术结扎输精管，精道及其周围组织的慢性炎症等。
2、逆行射精
如膀胱颈部曾做过手术或受到损伤或手术后瘢痕挛缩使尿道畸变形，双侧腰交感神经切除术后或直肠癌腹会阴手术后，糖尿病引起的阴部神经损害，精索囊肿肥大，以及严重尿道狭窄，某些药物，如肾上腺素阻滞剂等可引起支配膀胱的交感神经功能改变。
3、外生殖器异常
如先天性阴茎缺、如阴茎过小、男性假两性畸形、尿道上裂或下裂、后天性阴茎炎症或损伤、阴囊水肿、巨大睾丸鞘膜积液等。
4、男性性功能障碍
阳痿、早泄、不射精等。
（四）全身性因素
1、精神和环境因素
生活环境突然改变导致长期精神紧张，进行高空、高温、超强度劳作以及从事放射线工作。
2、营养因素
严重的营养不良，维生素A、维生素E缺乏症，微量元素如锌、锰缺乏，钙、磷代谢紊乱，汞砷、铅、乙醇、尼古丁、棉子油等毒性物质慢性中毒，化疗药物治疗等。
3、内分泌疾病
如垂体性侏儒症、肥胖、生殖无能综合征、腺垂体功能减退症、先天性性腺不发育症、先天性生精不能综合征、高催乳素症、垂体瘤或颅内感染、产伤等。