危害一：循环系统
肥胖对心血管系统危害最大。肥胖者容易患高血压，因为肥胖者的血管壁容易有脂肪堆积，而血管外也被脂肪包围压迫着，导致血流阻力变大，血管较不畅通，血管壁弹性变差，最终导致高血压。另外肥胖者血清胰岛素含量升高，会促使钠的再吸收增加和交感神经的紧张度增加进而诱发高血压。肥胖患者由于身体过重使血液循环需求量增多，心输出量加大，这样毫无疑问就加重了心脏的负担；同时心脏本身内外亦多有脂肪沉着，易导致心肌劳损，最终导致左心衰竭。
危害二：呼吸系统
肥胖危及人的呼吸。当人的体重增加时，肺部就必须输送更多的氧气供给人体所需，然而，肺不会因为人的体重增加而相应变大。此外，下腹部肥厚的脂肪也会限制肺的呼吸活动。肥胖患者常出现睡眠窒息综合征，表现为肺部高压症和低氧血症，极易引起呼吸衰竭和心力衰竭甚至危及生命。
危害三：内分泌系统
肥胖可促使高脂血症和糖尿病的发生，糖尿病对心血管系统造成动脉硬化及微血管病变。动脉樱花可引起冠心病，脑血管病；心脏微血管病变可引起心肌广泛性坏死、心律失常、心力衰竭，甚至心源性休克和猝死。糖尿病肾病主要为肾小球微血管病变、肾动脉硬化和急、慢性肾盂肾炎。糖尿病之视网膜病变是糖尿病患者失明的主要原因。
危害四：泌尿系统
肥胖患者常伴其他代谢性疾病。如肾脏改变常为肾小球滤过率和肾血流增加，肾小球肥大。1974年Weisinger首次报告1例重症肥胖患者合并肾病性蛋白尿，从那时起，人们才把肥胖与肾小球肥大以及局灶节段肾小球硬化相关性肾病（ORG）。体重过重，易伤害肾脏，因为肾病的两种起因糖尿病与高血压都与肥胖有关。
危害五：生殖系统
肥胖患者常伴有肥胖性生殖无能综合症或肥胖性生殖器官退化症。生殖激素很容易在脂肪中溶解，生殖激素在产生后即溶解并储存于过量沉着的身体脂肪中。肥胖男性血中睾丸酮偏低，雌激素偏高（较正常男性高1倍以上）。原因在于，体脂量增加可使雄激素较多地转化为雌激素，而且后者又抑制垂体促性腺激素分泌，进而使睾丸酮分泌减少，可使男子阳刚之锐减，性功能不同程度的降低。男性肥胖患者多有阳痿或少精症存在。女性肥胖者性欲普遍低下，其原因也与体内雄激素水平低下有关。除此之外，肥胖对卵巢功能有明显影响，表现为卵泡发育异常拍滦障碍、发育不良等。肥胖女性常常出现月经紊乱，包括不规则的出血、闭经、不孕很常见。有时伴有多囊卵巢综合症。
危害六：消化系统
脂肪往往附着或聚集于肝脏会造成脂肪肝，进而引起肝细胞坏死，导致肝硬化。甘油三脂溶度增加，胆固醇增多与胆囊疾病的发生。很多肥胖的人不愿吃含纤维多的食物，只喜爱吃肉类、蛋类、糖类，由于食物纤维不足，消化道缺少刺激，使肠蠕动减弱，排便次数就少了形成便秘。这种生活习惯，会使剩余的食物长期滞留在肠内，甚至形成不正常的发酵腐败，腐败的粪便产生刺激血管收缩的毒性物质，有损健康。长期便秘的人易发大肠癌及其它肛肠疾病。
危害七：运动系统
由于全身的重量都是由下肢来支撑，过重的身体会令腰膝关节磨损，令退化性关节炎恶化。过重的身体还会给背腰肌、韧带、筋腱等过大的曲张力，从而导致背腰痛，时间久了会形成慢性背部疼痛。
危害八：神经系统
肥胖多易引起代谢性疾病如糖尿病，则可累及周围神经出现肢端有异物感如麻木、针刺、灼热、踏棉花感等。进而致肌力减低、肌萎缩、肌无力甚至瘫痪。此外，肥胖与癌症关系密切，据有关资料统计显示，男性肥胖患者的肛门直肠癌、前列腺癌和女性患者胆囊、子宫颈、子宫内膜、卵巢和乳腺等癌症的发病率及死亡率均增加。其原因主要是由于食物中的致癌物质大多数是脂溶性的，可随脂肪消化吸收进入体内，故引起发生癌的机会增多。