闭经的主要是因为女性卵巢功能逐渐衰退，停止排卵所致。在临床上，可以需要通过了解患者病史和相关体检状况，就可以查出闭经的真正根源。此外，还可直接采用一系列的辅助诊断，如周血染色体检查、腹腔镜检查、肾上腺功能测定等措施来明确诊断。
确定闭经根源的检查方式
1、周血染色体检查
对原发性闭经（原发性闭经【译】：指凡妇女年满18岁或第二性征发育成熟2年以上仍无月经来潮者。），应常规行外周血染色体检查，特别是身材矮小、发育迟缓、乳房不发育或外生殖器畸形者，更应检查染色体组型，以明确闭经的原因。
2、腹腔镜检查
可直接观察子宫、输卵管和卵巢的形态，并可作卵巢活组织检查，对诊断卵巢早衰或多囊卵巢综合征有帮助。
3、肾上腺功能测定
怀疑闭经与肾上腺功能异常有关时，可进行尿17-酮和17-羟测定。
4、诊断性刮宫
此法适用于已婚妇女。对疑有生殖道结核，或闭经发生在人工流产后的患者，经刮宫可以了解子宫腔的大小，宫颈或宫腔有无粘连。刮出的子宫内膜作病理切片检查，可间接了解性激素的分泌情况，以及诊断子宫内膜结核。
5、子宫输卵管碘油造影
有助于诊断生殖系统发育不良、宫腔粘连及生殖道结核等。
6、甲状腺功能测定
考虑闭经与甲状腺功能异常有关时，应进行吸碘试验及T3、T4测定。有的高催乳素血症患者可能是由于原发性甲状腺功能减退所引起。
7、甾体激素放射免疫法测定
在闭经诊断的第一步骤中，要求对体内雌激素水平作出初步估计。用放射免疫法测定血中甾体激素可提供闭经病因的诊断，例如血E2很低，合并FSH 异常增高时，提示卵巢功能衰竭；血睾酮增高常提示有多囊卵巢征群，或有分泌雄激素肿瘤存在的可能；含Y染色体的闭经患者，也可能有血睾酮增高现象。
8、蝶鞍多向断层摄片
主诉闭经合并泌乳的患者，应进行蝶鞍多向断层摄片。蝶鞍多向断层摄片可发现3～10mm大小的微型腺瘤，表现为蝶鞍前壁下方的一侧凸出与蝶鞍底板前方或后方侵蚀。
