急、慢性扁桃体炎都可以引起多种并发症。局部并发症有急性中耳炎、鼻炎、鼻窦炎、咽炎、颈淋巴结炎、扁桃体周围脓肿等。全身并发症常见的有风湿病、急性肾小球肾炎、败血症、关节炎、皮肤疾患（如银屑病）、心肌炎、支气管哮喘等。 扁桃体炎引起全身疾病的机理目前尚不完全明了。感染学说认为是溶血性链球菌及其毒素间断地进入血流或淋巴，导致远隔部位的疾病。
近年来由风湿病患者的咽部、血液和心瓣膜上分离出Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅶ型腺病毒，并认为链球菌的透明质酸酶能增加咽部组织的通透性，使病毒易于侵入人体而致病。变态反应学说认为小窝内的细菌及其毒素、代谢产物或病毒等，进入体液后，可引起抗体形成，通过抗原抗体结合，产生复合物而导致其他部位的病变。感染变态反应学说认为上述两种过程同时存在，共同起作用。此外，尚有其？说法，但各种学说都缺乏足够的证据。 扁桃体炎一般是指腭扁桃体的非特异性炎症，可分为急性扁桃体炎、慢性扁桃体炎。
急性扁桃体炎大多在机体抵抗力降低时感染细菌或病毒所致，起病急，以咽痛为主要症状，伴有畏寒、发热、头痛等症状，是儿童和青少年的常见病。慢性扁桃体炎是由于急性扁桃体炎反复发作所致，表现为咽部干燥，有堵塞感，分泌物粘，不易咳出，口臭，其反复发作可诱发其他疾病，如慢性肾炎、关节炎、风湿性心脏病等，因此须积极治疗。患者平时要锻炼身体，增强体质，注意口腔卫生，及时治疗附近组织的疾病，饮食宜清淡，不吃辛辣刺激性食物，戒除烟酒，一旦本病成为诱发其他疾病的病灶，或有其他手术指征时则应考虑手术治疗。
本病相当于中医学“乳蛾”的范畴，急性扁桃体炎相当于“风热乳蛾”，慢性扁桃体炎相当于“虚火乳蛾”。风热乳蛾多因气候骤变，寒热失调，肺卫不固，致风热邪毒乘虚从口鼻而从侵喉核，或因过食烟酒等，脾胃蕴热，或因外感风热失治，邪毒乘热内传肺胃，上灼喉核，发为本病；虚火乳蛾多因风热乳蛾或温病之后余毒未清，邪热耗伤肺阴，或因素体阴虚，加之劳倦过度，肾阴亏损，虚火上炎，蒸喉核，发为本病。
