中医学认为，多因风热乳蛾或温热病后，余邪未清，邪热灼伤肺阴，津伤则咽窍少濡；炼津为痰，痰热结聚喉核，故喉核红肿为病。或因乳蛾日久，由肺及肾，金燥水涸，肾阴亏虚，阴亏液乏则咽窍失滋，阴虚火旺则喉核受灼，故喉核挛缩为病。

现代医学认为，本病由于急性扁桃体炎治疗延误而致。有时也可发生于某些急性传染病如猩红热、白喉、麻疹、流行性感冒之后。由于细菌、病毒的感染，导致扁桃体隐窝内有脓性分泌物，扁桃体隐窝内引流不畅，窝内病原体滋生繁殖而演变为慢性炎症。

其病理的改变主要在扁桃体隐窝内。隐窝内聚集脱落的亡皮组织。淋巴细胞、白细胞及细菌等形成栓子，阻塞隐窝，导致隐窝内引流不畅形成小的囊肿或小的 脓肿。当机体抵抗力下降时隐窝内细菌大量繁殖致扁桃体内淋巴增生，淋巴滤泡增多，引起扁桃体肿大。反复感染导致淋巴坏死，纤维组织增生，引起扁桃体萎缩。

在中医看来，扁桃体炎的病因是人体内部一些器官发生的热气没有及时地消散下去，从而导致器官的损伤，而由于体内器官的协调，一个器官的损伤必然会对另一个器官造成影响，进而导致我们体能的扁桃体发炎。

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