乙肝大三阳会出现血液系统病变，急性乙肝常有不同程度的血液改变和骨髓再生不良。乙肝大三阳可发生再生障碍性贫血，男多于女，病情进展较快。由于肝合成凝血因子减少，脾功能亢进时血小板减少，毛细血管脆性增加等原因，致使这类患者易出现齿龈出血、皮下出血及皮肤紫斑。

肾脏病变，乙肝合并肾脏损伤，以肾病表现为主，无一定规律可循。神经系统病变，可引起多发性神经根炎或多发性神经炎伴上升麻痹及细胞蛋白分离，也就是格林一巴利综合征。

心血管病变，可出现心肌炎、心包炎，可侵犯动脉血管而发生结节性动脉周围炎，此病可发生于乙肝大三阳前、乙肝大三阳期间或乙肝大三阳后，大多数常与慢迁肝或慢活肝一起形成双重炎症。

消化系统病变，乙肝大三阳早期胃肠黏膜可出现炎性改变，故有上腹不适、恶心、呕吐等乙肝大三阳的症状。慢性乙肝常出现肠壁黏膜水肿。此外，胆管炎、胆囊炎也很常见，还多见急性水肿性胰腺炎。

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