原发性肝癌其实是多因素协同作用的结果，它的发生是多阶段的。由于生物因素、化学因素等的作用，使肝细胞DNA产生不可逆变化，下面就一起了解一下原发性肝癌诱发原因。
病毒性肝炎：病毒性肝炎与肝癌的关系已知涉及乙型（HBV）、丙型（HCV）、丁型（HDV）3种肝炎病毒。在我国HBV是肝癌的主要病因。日本等国家主要是HCV。俄罗斯等国家主要是HDV。世界卫生组织在1983年肝癌预防会议指出，HBV仅次于烟草（与肺癌），是第二种已知的人类致癌物。WHO1987年第三次病毒性肝炎技术的咨询组会议指出，40%以上的持续感染者成年后，会因为HBV导致肝硬化或肝癌而死亡。
遗传：肝癌高发区发现肝癌是有显著的家族聚集性，尤其是有血缘关系的、近亲的、共同生活的家族中肝癌发生率高。从染色体分析，细胞免疫水平，DNA修复的能力和遗传标记等检测中，均提示肝癌是具有遗传的生物学基础。目前认为肝癌的是具有主基因效应的多基因遗传病。
黄曲霉毒素B1（AFB1）：我国流行病学调查曾一再提示，肝癌高发区是粮食的易受AFB1污染的东南沿海的温湿地带，尤其是，食用霉菌毒素污染的玉米和花生油的产地区。1991年美国学者许（Hsu）在基因水平中发现，AFB1是人肝癌的致癌剂，引起人们高度关注。世界癌症研究中心（IARC），在1979年发表的文集中，已评定黄曲霉毒素是具有足够证据的人的致癌物。HBV的感染与黄曲霉毒素的摄入量对人肝癌的发生有明显协同作用。
饮水污染：肝癌高发区调查表明，饮用污染严重的沟、塘水者肝癌的死亡率是高于饮用井水者的，饮用深井水者肝癌死亡率最低。最近由于水质分析技术进步，我国及台湾地区均能发现水中微囊藻毒素有明显促肝癌作用。
微量元素：目前在微量元素与肝癌关系的研究中发现，肝癌死亡率是与环境中硒含量呈负相关的，与居民血硒水平呈负相关，在动物试验中表明硒能阻断黄曲霉毒素诱发大鼠和鸭子发生肝癌。