乙肝“两对半”即HBsAg、抗HBs、HBeAg、抗Hbe和抗HBc等，做为乙型肝炎病毒感染血清学标志物，其临床意义主要用于判断患者是否感染过乙肝病毒。但现在有些临床实验室开展的乙肝“两对半”的定量测定，竟然用以判断乙肝患者临床治疗的效果，这是一个误区，是对这之间的关系不了解所致。
目前针对感染性疾病抗病原体的药物治疗主要有两类，一是杀灭，如梅毒和结核病的抗菌素应用治疗；二是抑制，如乙肝和丙肝的抗病毒治疗。当治疗有效时，前者表现为病原体的消失，后者表现为病原体数量的动态性降低。因此，与治疗效果密切相关的是病原体的存在与否或存在数量的多少。而抗体，因其是机体对病原体特定抗原成分的特异免疫应答的产物，即使是病原体因抗菌或抑病毒药物的应用已消失或大大减少，也可能在体内存在相当长一段时间或持续存在，其与病原体的存在与否或存在数量无正相关关系。
也许有同道要问，那么病原体抗原呢？那不是病原体上的一部分吗？应该说其含量高低与病原体之间有正相关了吧。这要具体情况具体分析。如上面提到的HBsAg和HBeAg就不行，因为HBsAg在乙肝患者血循环中以三种形式存，即圆形颗粒、管形颗粒和Dan颗粒，其中只有Dan颗粒中存在乙肝病毒，但其仅占所有HBsAg的0.2%，其他绝大部分为空的圆形颗粒和管形颗粒，所以HBsAg和乙肝病毒之间自然就缺乏正相关。而HBeAg通常与乙肝病毒存在之间有很好的正相关，它也是乙肝患者传染性强弱的一个主要血清学指标，按理应该可以作为乙肝患者抗病毒疗效的观察指标，实际上也有很多人在这样做，但由于乙肝病毒基因组的前C区常易出现点突变，使得HBeAg表达的缺失，此时血清HBeAg测定为阴性，但病原体仍大量存在。因此，HBeAg也不能作为乙肝患者抗病毒疗效观察的指标。
在乙肝“两对半”中，真正有定量测定价值的只有抗HBs，但这种测定也不是用于临床乙肝患者疗效观察，而是用于人群乙肝疫苗注射效果的判断，也就是说，当某人注射疫苗后，如外周血中抗HBs定量超过10mIu/ml，则说明受免疫者具有对乙肝病毒免疫力，免疫力及持续时间与抗HBs含量高低应成正比。