丙型肝炎病毒跟其他病毒不同，急性感染后很少引发症状，就算有也只是疲倦，胃口差等轻微的不适感，所以很多人感染了病毒也不知道。因为这一病毒的感染率远小于乙型肝病毒的感染率，所以一般的体检只会检验乙肝的抗体或抗原，而不会包括HIV丙型肝炎快速测试（酶联免疫吸附试验），令隐性的丙肝带菌者很难及时知道自己已受感染的事实。
多数的患者就这样变成慢性丙肝带菌者，更可怕的是感染后的15~20年内，都不会有任何明显症状。丙肝带菌者大多是因为捐血，才知自己是带菌者。也有部分患者是因为体检报告显示其肝酵素谷丙转氨酶指数高于正常，接受进一步检验后，无意中发现肝功能的指标不正常是因为感染丙肝所致。
丙肝病毒可致肝癌
虽然感染丙肝病毒的人只是极少数，但在肝癌患者中，也有相当一部分的患者是因为丙肝感染致病。潜藏人体的丙肝病毒会慢慢破坏肝脏，最少20%带菌者会演变成肝硬化，这时如果仍不给予适当治疗，就会发展成肝衰竭或肝癌，最后只有进行肝脏手术切除及肝脏移植。目前，丙肝的感染途径主要是血液传播（理论上体液也可以构成感染），故多见于滥用注射药物的吸毒者、白血病者、血液透析肾病、艾滋病等患者。
无症状阶段病毒可清除
丙肝病毒不像乙肝患者一辈子带菌，丙肝带菌者只要在“无症状阶段”，接受标准混合疗法，可完全清除病毒的痊愈率约55%。丙型肝炎有6个基因分型，其中基因分型第二及第三型患者，用药后痊愈率更高达80%。当然，病毒量较少、无肝硬化、非基因分型第一型、肝醇素指数升高、体重较轻及无脂肪肝问题者，疗效都会较理想。
混合疗法的副作用也不容忽视，除了患者会有类似感冒病症（如全身酸痛、疲惫、轻微发烧）、胃口变差、躁热喉咙干、掉头发等，基于干扰素有引发情绪抑郁的副作用，故用于严重精神病或抑郁情绪时加倍小心，以免令病情恶化。另外，如病人兼有肝硬化、白血球过低、严重贫血、严重心脏病等病症，则也未必能承受药物的副作用。因为会影响精子及胎儿发育，故治疗期间及治疗后的6个月，患者也应避免怀孕。
