慢性的治疗目前仍是个老大难，而慢性乙肝和丙肝的混合感染则更是难中之难。所谓混合感染就是指一个病人既感染了乙肝病毒又感染了丙肝病毒。调查得知，乙、丙肝混合感染在慢性乙肝中约占10%，慢性乙肝现患者约3000万，那么全国就约有300万人是乙、丙肝混合感染。
虽说α干扰素是对乙肝病毒和丙肝病毒同时有效的药物，但在实际应用中疗效很不理想。据研究，在人体内乙肝病毒和丙肝病毒之间可以相互作用，从而影响α干扰素的疗效。
有人观察发现，乙、丙肝混合感染用干扰素后，其疗效明显低于各自的单一感染。当病人注射重组α干扰素后，研究者发现，丙肝病毒被清除，而乙肝病毒却被激活。也有人发现，应用α干扰素后乙肝病毒核酸阴转，但随后出现了丙肝病毒核酸，并且出现了明显症状乃至发生，病人病情加重了。所以，有关专家多不主张用α干扰素治疗乙、丙肝混合感染。
目前，治疗慢性乙肝，专家们推荐使用拉米夫定，它是一种核苷类似物，对乙肝病毒核酸有明显的抑制作用，有人为了增强疗效，采取拉米夫定联合α干扰素治疗慢性乙肝。按理说，此两种药对乙肝病毒的作用位点不同，联合应用应该有协同作用，但事实并不是这样，二者联用与单用拉米夫定治疗乙肝之疗效并无显著差异。
不过，在临床实践中发现，拉米夫定联合α干扰素治疗乙、丙肝混合感染的疗效则较好。如有一病人的转氨酶常年不正常，开始时并不知道这是一例乙、丙肝混合感染，在治疗中复查病毒指标才得知这一情况。在联合应用拉米夫定和α干扰素治疗3个月后，效果非常理想，病人转氨酶正常，症状消失，且乙肝病毒核酸亦转为阴性。这时加大α干扰素剂至500万单位/次，结果丙肝病毒核酸也阴转了。随后治疗的3例混合感染病人，都达到完全应答。推想，可能是拉米夫定强力抑制乙肝病毒核酸，而大剂量α干扰素主要是抑制丙肝病毒核酸，两种药物在人体内各司其职，不会产生激活作用。