在慢性乙型肝炎由血清HBeAg转换为抗HBe，随之病毒血症水平降低而病情逐渐缓解。但有的病人继续高水平的病毒血症，病变进展，ALT长期不正常，在随访中可有多次再活动，即是此节讨论的抗HBe（+）的慢性乙型肝炎。在慢性乙型肝炎中抗HBe（+）的约占20%。抗HBe（+）慢性乙型肝炎是一个特定的临床实体，界定为病变活动，血清中可检出HBVDNA，IgM抗HBc也可阳性。
发病机制： 在抗HBe（+）慢性乙型肝炎，感染的常是不能转译HBeAg的HBV变异株。包括缺乏HBeAg分泌的HBV/前C终止密码子变异和X编码区的C基因启动子（cp）变异，还常有C基因的聚集变异。抗HBe（+）慢性乙型肝炎虽常由上述变异病毒感染所引起，但这些变异与病变发展的关系尚未充分阐明。
一般认为：HBeAg在血行中可接触胸腺，抑制HLAI限制的、HBe/cAg特异的辅助性T细胞功能，从而介递对HBV的免疫耐性。在前C/A83变异病毒感染；不产生HBeAg，免疫耐性降低，免疫清除机制运作而肝细胞损伤。但由于感染肝细胞缺乏靶抗原之一的HBeAg，CTL的清除效率低，HBV感染仍能长期持续。HBeAg与HBcAg有约70%的共同序列，两者有交叉反应性，HBeA笆消失后仍可有抗HBe应答。 抗HBe（+）慢性乙型肝炎虽最常由前C/A83变异病毒感染所引起，也可以是静止的野生病毒感染，因重叠其它病毒感染而引起活动性病变。重叠HCV或HDV感染在抗HBe（㈠慢性乙型肝炎中有一定的病原学意义，但最重要的仍可能是变异的HBV。在我们研究的60例不同类型的抗HBe（+）活动性慢性肝病中，由变异病毒所致者占90%。
临床特点：与HBeAg（+）的慢性乙型肝炎比较，抗HBe（+）慢性乙型肝炎有一些不同的特点。HBV感染发生变异的病史较长，故病人群体平均年龄较大。变异株复制缓慢，病毒血症水平较低传染性亦较低。 抗HBe（+）和HBeAg（+）慢性乙型肝炎的组织病变的Knodell总积分无显著差异，但HBeAg（+）慢性乙型肝炎以炎症坏死积分、抗HBe（+）慢性乙型肝炎以纤维化积分显著较高。抗HBe（+）慢性乙型肝炎病人肝硬化发生率显著较高，可能是病情缠绵、病变累积的结果。
HBeAg（+）和抗HBe（+）慢性乙型肝炎的发病，同样反映对复制病毒的免疫清除过程：HBeAg（+）慢性肝病病人的感染水平较高，病变活动性较高，发展也较快；但病毒可能清除而病变缓解。抗HBe（+）慢性肝病的病变活动性常较低，但感染较长期持续，病变常逐渐进展。就群体而言，抗HBe（+）慢性乙型肝炎较HBeAg（+）者更多反复活动，故发展至肝硬化和HCC的也较多。抗HBe（+）慢性乙型肝炎的病毒血症、ALT和IZM抗HBc血清水平常波动，间歇期中常呈静息状态，发作时依次出现：病毒再活动、ALT急升、IgM抗HBc滴度增高。
抗病毒治疗： 与HBeAg（+）的慢性乙型肝炎不尽相同。对50%抗HBe（+）慢性乙型肝炎病人，α干扰素治疗可抑制HBV复制，并使ALT降至正常，但较多的病人将复发，疗程需延长。因而，干扰素治疗应尽早在HBeAs（+）、免疫清除的早期、病毒尚未变异前开始。 HBeAg（+）慢性乙型肝炎和抗HBe（+）慢性乙型肝炎病人用核苷类似物的治疗效果相同，但也易复发。