胆管系统是肝脏向十二指肠内排泄胆汁及其他代谢产物的特殊管道结构系统。它分为肝内胆管系统和肝外胆管系统两部分。

肝内胆管系统是起源于肝细胞的毛细胆管至肝门出肝的左右肝胆管之间的胆管系统，由毛细胆管、细胆管、小叶间胆管和左右肝胆管组成。

肝外胆管是指左右肝胆管开口以下的肝外部分的胆管，包括肝总管、胆囊管、胆总管。肝脏发炎时，破坏了肝小叶正常结构，新生的肝细胞排列不整齐，阻塞小胆管，使胆红素不能通过正常渠道运行，而大量反流入血。血液中增高的胆红素把眼巩膜和全身皮肤染成黄色，医学上称为“黄疸”。

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