甲型肝炎病毒主要经粪-口传播，故对甲肝的预防应提高个人卫生水平，加强饮食、饮水及环境卫生管理，搞好粪便和污水的无害化处理。一旦发现病人，及时隔离传染源，隔离期为3周。
采用甲肝疫苗进行主动免疫也是降低甲肝发病率的主要有效措施。常用的甲肝病毒灭活疫苗和减毒活疫苗，一般在流行季节或流行地区可进行预防接种。
此外，甲型肝炎预后通常良好，但慢性肝病者发生重度或爆发性甲肝的危险性增高。所以有人主张对慢性乙型肝炎病毒感染者，进行灭活甲肝疫苗接种，有较好的预防甲肝的作用，且不良反应很少。
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