新生儿的一些器官和组织还没有完全发育成熟，新陈代谢旺盛，血液循环需要的时间短，吸收、排泄都比较快，抵抗力弱，所以容易生病，但新生儿对药物的反应敏感性强，因此给新生儿用药应慎之又慎。
1、避免使用解热镇痛剂类的药物等。因为这类药物可引起新生儿青紫症、贫血，以及肚脐出血、吐血、便血等。如果非万不得已必须使用时，也应注意剂量切忌不可过大，用药时间不可过长。
2、注意某些抗生素的使用，都容易引起黄斑牙；氯霉素可抑制骨髓的造血功能，可使服药的新生儿发生再生障碍性贫血和粒细胞缺乏症；新霉素可引起新生儿高胆红素血症和耳聋。
3、尽量避免用药或使用中药制剂，避免其生病。另外，在新生儿发热、炎症时尽量选用一些中成药冲剂和糖浆制剂服用。
新生儿用药应注意以下几方面的问题：
一、及早用药
新生儿抗病力弱，往往起病较急，病情变化较快，而疾病的临床表现常不典型、不易被察觉。因此，必须善于观察病情，及早诊断，及时正确用药。如常见的新生儿败血症，常有发烧及白血球升高等现象，而仅表现出神情发呆、吃奶不香，如不能及时早治，正确用药，就会延误病情。
二、慎重用药
新生儿，尤其是未成熟儿，肝肾功能发育不完善，系统活力欠佳，用药时如不仔细斟酌，精确计算，常会引起严重的中毒反应。如用氯霉素后可引起灰色综合征；磺胺类药及大量维生素K等可引起新生儿高胆红素血症，甚至核黄疸；冬眠灵可引起高铁血红蛋白血症；大剂量使用链霉素，不仅可使听神经受到损害，而且还会引起昏迷，导致死亡。
三、外用药物应警惕中霉反应
普普通通的鼻眼净、皮炎激素软膏、新霉素油膏等，都可引起严重副反应。常用鼻眼净可能引起昏迷、呼吸暂停、肌张力减低等，治疗皮肤病用的皮炎激素软膏，对新生儿大面积使用，可引起全身性水肿。这主要是由于新生儿皮肤薄嫩，皮肤黏膜面积相对大，有很强的呼吸作用，当有炎症或破损时，对药物的吸收作用更强更快。因此不能把成人用的外用药随便用于婴儿。
四、注意用药途径及次数
新生儿、未成熟儿、重危病儿不宜给丸、片剂型药。因此，片剂均应研磨成粉或调配成液体，用滴管慢慢喂服，病情重者尽可能静脉点滴给药。因为新生儿新陈代谢旺盛，对药物的吸收快，排泄亦快，给药时应根据病情，按体重或体表面积计算出每日应给药物的总量，把总量分为三四次。
另外，应注意药物分配及副作用，待病愈后，再用药一二天，巩固疗效。