新生儿生后12小时内应进行全面体检，通过全面体检确定新生儿发育健康。新生儿体检包括通过体格和神经肌肉检查更准确地判断胎龄。
体检项目一、测量
身长的测量是从头顶到足跟，头围大约应是身长的一半加10cm。足月儿的平均体重是3.2kg。测得的新生儿的大小与相应的胎龄对比，可能对一些情况提供重要的线索。例如，如果婴儿小于胎龄，可能是由于宫内感染或染色体畸形所引起。而若婴儿大于胎龄，可能是因为母亲患糖尿病或高胰岛素血症，如Beck-with综合征，由于大血管错位引起的发绀型先天性心脏病，母亲肥胖症或家庭的素质如在Crow和Cheyenne地区的印第安人。
体检项目二、肌肉骨骼系统
肢体应该对称且能自主活动。新生儿仰卧，髋关节和膝关节屈曲时，股部能完全外展到检查桌平面。外展受限，且当股骨头滑入髋臼时可摸及弹响声，是先天性髋关节脱位的主要体征。女婴和臀位产婴儿特别容易发生髓关节脱位。若髋关节活动受限，应作超声检查并请矫形外科专家会诊。极轻微的先天性髋关节发育不良，可用两块或三块尿布兜起来，这种方法很适用。比较严重的病例，可以由矫形外科医生在超声观察检查下应用外展夹板治疗。若不能马上请矫形专家治疗，可每天24小时应用三块尿布兜起，一直到能使用夹板时为止。假如用任意形状的尿布，第一块尿布应紧贴皮肤包紧，另两块作为外层，一起形成较大的体积。如果有畸形足或任何其他明显的需矫形的畸形存在，应立即开始治疗。
体检项目三、心肺系统
正常情况下，呼吸为腹式呼吸，呼吸频率40~50次/分，呼吸音粗但整个胸部的听诊音相同。用听诊器可听到心音，胸骨下端最清楚。心率100~150次/分，可有明显的窦性心律不齐。常可听到心脏杂音，但其中大约只有10%与先天性心脏病有关。有严重的先天性心脏疾病的新生儿，例如大动脉闭锁，右或左心室发育不全，可表现出苍白或心力衰竭。
可扪及股动脉搏动，检查时两侧同时进行，比较他们的搏动强度。若股动脉搏动微弱，可能存在主动脉闭锁或左心室畸形。股动脉搏动微弱时应用多普勒血压计测定所有肢体来加以确定。多普勒血压计是用一个装在充气膨胀的袖带上的超声传感器，探测放气时血管中的涌流，从而精确地测定收缩压和舒张压。此外，转红试验也可用于测定血压。抬高肢体直到皮肤变苍白，使血流排尽，然后对事先绑好的血压袖带像常规测量血压一样充气，将肢体置于病儿一侧，逐渐降低袖带的压力，当肢体颜色转红时记下读数。
