到目前为止，医生还不能给出有病因的痛经，一般来说：原发性痛经是因为子宫本身因素所造成，也就是由于子宫基层或是子宫内膜的前列腺素分泌过度所引起的。
痛经最常见的危害是：
慢性盆腔炎：是妇科临床常见的疾病，该病的表现轻重不一，轻者一般无症状，重者多有白带增多，轻度痛经、月经淋漓、下腹隐痛、小腹下坠、腹胀腹泻、里急后重、尿频尿热、腰骶酸痛、性交痛等。由于盆腔淤血，甚至会导致输卵管粘连阻塞而致不孕，因此需要引起人们的注意。
子宫内膜异位症是在子宫腔以外其他部位所引起的一种病变。症状呈周期性发作，痛经为最常见的特征，疼痛于经前1~2天开始，经期第一天最为严重，经血干净后逐渐缓解以至消失。子宫内膜异位在盆腔内常引起生殖器官粘连和输卵管阻塞不通，从而导致不孕症，不孕的发病率高约75%，另外，由于异位的部位不同，还会出现性交痛、肠道症状及泌尿道症状。
由于目前研究认为痛经的发生跟前列腺素的分泌有关，因此经痛最好的治疗方式就是阻断前列腺素的合成，也就是防止疼痛的发生，而不是治疗已发生的疼痛。
痛经有关的因素是：
（1）注意经期、孕期卫生不够；过早开始性生活；性伴侣数多，引起炎症。
（2）过度的人工流产手术或宫腔操作，引起粘连炎症。
（3）避孕情况：痛经与工具避孕间存在一定关系，尤其是宫内节育器—避孕环的安放，常常可以加重痛经的程度，这可能是宫内节育器放置后，子宫内膜组织前列腺素（PG）生成量增高，导致痛经加重。而避孕药内含有孕激素，孕激素有使子宫平滑肌松弛的作用，故可减轻因痉挛产生的疼痛症状。口服避孕药则会降低原发痛经的发生率以及痛经的程度。
（4）月经周期及经期长短的影响：一般痛经的严重程度并不受月经周期长短的影响，但由于痛经本身表现经期腹痛，故若经期时间较长者往往疼痛持续的时间也长，这在子宫内膜异位症患者中表现最突出。
