近年来，由于免疫组化实验方法在各医院病理科的迅速普及，许多患者的术后标本可以进行免疫组化检查。这对于患者的诊断、分型以及术后的综合治疗有着重要的意义。
一、多耐药（MDR）基因
肿瘤细胞耐药是化疗失败的主要原因，引起耐药的重要原因之一是多药耐药性，即肿瘤细胞接触一种抗癌药物产生耐药性后，对多种结构和作用机制不同的其它抗癌药也产生耐药性。多药耐药（MDR）基因的产物P糖蛋白（P-gp）是一种跨膜蛋白，作为药泵功能引起癌细胞产生耐药，它具有膜转运蛋白的许多结构特征，一旦与抗癌药物结合，在ATP供能下，将药物由胞内泵出胞外，因而胞内药物浓度不断下降，以致无法发挥细胞毒作用，出现耐药性。阳性表达的细胞对化疗剂尤其是蒽环类和长春花碱类及阿霉素等化疗剂，具有固有和获得性耐药。P-gp表达可见于高度固有耐药的肿瘤，在这些肿瘤，P-gp的高水平表达亦见于产生这些肿瘤的正常组织。对化疗敏感的肿瘤通常P-gp表达率低，那些对系统化疗最敏感的实体瘤（精原细胞瘤和胚胎性癌）很少出现P-gp表达，曾接受过化疗患者发生的肿瘤常有P-gp表达增强。检测P-gp表达有助于确定可能对常规化疗耐药的肿瘤，从而提供适合于这些病人合理的替代治疗方法，对肿瘤病人选择化疗方案和预后的判断具有重要的临床意义。
二、激素受体（ER）和孕激素受体（PR）
人类最先发现乳腺癌细胞和激素的关系始于1896年。Bentson观察到乳腺癌患者切除卵巢后可使乳腺癌细胞的生长受到抑制。1967年Jensen发现人类乳腺癌中含有ER。从此开始了真正意义上的乳腺癌内分泌治疗的研究。女性正常乳腺的细胞上存在ER和PR，雌激素和孕激素通过ER和PR对细胞功能进行调节。当细胞恶变时，肿瘤细胞可以部分地或全部保留正常的受体系统，其功能与正常细胞相似。这种肿瘤细胞的生长仍然依赖原来的激素环境调节，称为激素依赖性肿瘤，临床上称为ER阳性乳腺癌。有些细胞在癌变过程中，其受体系统保留很少或完全丧失，不能再作为激素的靶细胞，其生长不再受激素的控制与调节，临床上表现为ER阴性乳腺癌。Jensen发现ER后，很快又发现PR，并证明PR的合成与雌激素和ER复合物在核内发生的变化过程有关，PR的形成直接受ER的控制和调节，故PR阳性的乳腺癌，ER大多为阳性。
临床上可以通过对雌激素受体（ER）和孕激素受体（PR）的检测，得出肿瘤细胞内激素受体含量的水平，从而提示乳腺癌的预后信息和指导内分泌治疗。据报道乳腺癌ER、PR检测的阳性率分别为40%～60%、30%左右。许多文献均已证实，ER、PR变化与乳腺癌病人预后密切相关，亦与其他公认的预后因素，如肿瘤分级、倍体性及分期有关。高分化肿瘤或临床分期较低的肿瘤ER、PR更可能阳性，受体阳性肿瘤细胞的明显减少与细胞增殖分级增高、c-erbB-2癌基因扩增增加及EGFR表达增加有关。免疫组化抗受体检测可预测乳腺癌对激素治疗的反应性。无ER或PR表达的肿瘤对激素治疗通常反应性差，而ER及PR阳性肿瘤则对激素治疗反应性高。事先未经激素受体测定的乳腺癌患者，应用内分泌治疗有效率只有30%；而经ER测定阳性者有效率达55%～60%，受体阴性者有效率5%～8%。TAM治疗无效的原因与ER的异常结构有关。
临床研究报道乳腺癌患者的结果表明：
1、乳腺癌术后辅助三苯氧胺（TAM）治疗可以明显降低复发率、死亡率；
2、TAM对绝经后患者有效，绝经前患者也有一定疗效；
3、ER阳性患者用TAM效果最好，ER不明的患者也有效；
4、辅助化疗后加用TAM，能进一步提高疗效；
5、延长服药时间能提高疗效；
6、服用TAM明显降低对测乳腺癌发生率；
7、长期服用TAM会增加患子宫内膜癌的风险。
乳腺中存在ER和PR，当乳腺上皮细胞发生癌变时，ER、PR会部分或全部缺失。如果乳腺肿瘤组织仍表达这两类受体，表明该肿瘤细胞仍受内分泌调节，仍可采取内分泌治疗。据文献报道，乳腺癌ER阳性率约为50%~80%，PR阳性率约为50%。两种受体对于指导治疗、疗效预测及预后评价有很大价值。ER和（或）PR阳性患者较ER和（或）PR阴性患者有较好的预后，前者的5年及10年生存率均高于后者，且前者接受内分泌治疗较后者有更好的疗效。