现代电疗除了上述副作用以外，还有不少缺点。首先，电休克治疗实施起来较为复杂且有一定的危险性，食道癌电疗周期需要全麻和吸氧，基层医院很难开展。其次，由于电休克治疗技术和设备等要求高，所以治疗费用也较高。再有，电休克治疗和药物治疗一样不能一劳永逸，要维持治疗，否则许多患者的病情就会复发。所以一般推荐在电疗后的6个月里，以药物治疗或者非经常性的电疗作为后续维持治疗。
食道癌电疗周期电疗和其他治疗方法一样，电抽搐治疗也有其特定的副作用和并发症。现代改良电休克治疗常见的并发症主要是头痛、恶心、呕吐和可逆性的记忆减退。记忆减退出现的比例较高，国外研究发现至少有1/3的患者表示在接受电疗之后，出现了明显的记忆衰退。食道癌电疗周期但是，一般认为电休克治疗对记忆的影响是有限的，并且通常只是暂时的，临床上这些症状一般在治疗后都会自行好转而无需处理。