新生儿百日咳是一种急性呼吸道传染病，新生儿百日咳影响着小孩的身体健康，而在对新生儿百日咳进行治疗前，是应该了解小儿百日咳的原因，以便尽量的帮助预防，那么，新生儿百日咳是怎么引起的呢？
引起新生儿百日咳的原因：
百日咳杆菌侵入呼吸道能产生许多毒性因子，如百日咳毒素、丝状血凝素、气管细胞毒素等，使气管黏膜发生炎症，细胞坏死，引起呼吸道黏性分泌物增加，刺激支气管神经末梢，反射性引起剧烈性连续性咳嗽，这叫痉挛性咳嗽，简称“痉咳”。这些毒性因子也会引起全身症状，如低热、恶心、呕吐、头痛、不适等。
病因一：不少孩子没有及时接种或没能全程接种预防疫苗（百白破三联疫苗），有人因为这种疫苗的副作用较大而不愿意接种。
病因二：百日咳杆菌“适应”了百日咳疫苗，产生了“免疫抵抗”，也就是说百日咳杆菌发生了基因变异，使原来的疫苗失去效用。
病因三：引起百日咳病症的病原菌更为复杂了，除了百日咳杆菌外，还有副百日咳杆菌也能引起百日咳样症状。
新生儿百日咳的临床症状如下：
一、前驱期：可见咳嗽、喷嚏、低热等上呼吸道症状。3～4天后，上述症状减轻，低热消失，咳嗽日见加剧，逐渐发展至阵发性痉挛期，本期传染性强。
二、百日咳痉咳期：一般为2～6周，特点为阵发性痉挛性咳嗽。发作时频频短促咳嗽呈呼气状态，伴1次深长吸气，此时产生高音调鸡啼声或吸气性吼声，然后 又是1次痉咳，如此反复多次，直至咳出大量粘稠痰或呕吐为止。痉咳时面红唇绀、舌外伸、颈静脉怒张，躯体弯曲作团状。可有眼睑浮肿、眼结合膜出血、鼻出血，重者可发生颅内出血。因摩擦舌系带而有溃疡，病情轻者，多数痉咳后一般情况尚好，神态、活动及饮食均如常。
三、恢复期：咳嗽逐渐减轻，吼声消失至咳嗽停止，精神食欲恢复正常。遇烟、气味、上呼吸道感染，痉咳可再次出现，但较轻。上呼吸道感染和支气管炎愈后，痉咳随之消失。
西医治疗新生儿百日咳的方法：
1、一般治疗 按呼吸道传染病隔离，保持室内安静、空气新鲜、温度适当，注意避免诱发患儿痉咳的因素，进食营养丰富，易于消化的食物，注意补充各种维生素和钙剂。镇静剂能减少患儿因恐惧、忧虑、烦躁而诱发的痉咳，同时保证睡眠，可服用异丙嗪（非那根）每次1m/kg、苯巴比妥等。咳嗽剧烈可用镇咳药，若痰液粘稠可用雾化吸人。如惊厥时用安定、复方氯丙嗪或苯巴比妥等药物止惊。小婴儿痉咳严重时应有专人守护。发生窒息时及时吸痰或作人工呼吸和给氧，如发生脑水肿，及时进行脱水治疗，防止脑疝出现。
2、抗菌治疗 卡他期应用抗生素可以减轻甚至不发生痉咳，进入痉咳期后应用，则不能缩短百日咳的临床过程。但可以缩短排菌期及预防继发感染，首选红霉素，百日咳杆菌对红霉素敏感，能渗进呼吸道分泌物中达到有效浓度，剂量：每日30～50mg/kg，口服或静脉滴注。7～14为一疗程。近年一些新的大环内酯抗生素如罗红霉素每日5～10mg/kg，分2次口服，7～10天为一疗程。阿奇霉素每日10mg/kg，一次顿服，3天为一疗程。后两者具 有抗菌作用强，胃肠道反应较少等优点，可酌情选用。氨苄青霉素临床疗效差，氯霉素，虽有较好疗效，但偶可引起粒细胞减少。
3、并发症治疗 合并支气管炎或肺炎时给予抗生素治疗，单纯肺不张可采取体位引流、吸痰、肺部理疗等，必要时用支气管镜排除局部堵塞的分泌物。