肛门脓肿一旦形成，应立即早期切开，减低局部张力，以阻断其扩散和向四周的蔓延；在脓肿清创时，应切除病变的肛隐窝，尽可能寻找内口所在；不论何种肛周脓肿，均应予以一次性根治，不留肛瘘等症；对于不同类型肛周脓肿，宜选择不同切口，以保证根治术的彻底成功。
六种不同的肛周脓肿症状：
1、肛周皮下脓肿：主要是疼痛，最初表现为胀痛、化脓时疼痛、排便时疼痛就更加严重，脓肿在肛门前方发生尿潴留，脓肿在肛门后方出现尾骶部的疼痛。全身好像中毒似的，局部肿胀，压痛、发红、有波动感。
2、直肠粘膜下脓肿：患者疲倦，发热。局部以直肠刺激症状为主，有里急后重，下坠，便次多或便意感等。
3、骨盆直肠窝脓肿：患者全身症状重，高热，周身疲倦，严重患者会有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有会有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。
4、坐骨直肠窝脓肿：患者有周身不适、发热寒战、体温升高等全身中毒症状。局部见肛门一侧肿胀、发红、跳痛、灼痛、压痛、坐卧不安，活动和排便时痛加重，有排尿困难等。
5、结核性肛门直肠周围脓肿：与上述细菌性感染不同的是，患者是慢性发病，脓肿经数周、数月后才会形成，局部疼痛不剧烈，伴有低热，局部红肿也不明显，破溃后流出的脓液清稀、脓口凹陷，周围皮肤发青或是呈青白色，常有多个流脓的外口，经久不愈。全身检查可以发现肺部、脓液培养可找到结核杆菌。
6、直肠后脓肿：全身症状和骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，患者不能端坐。
肛周脓肿的危害
1、瘘口、瘘管增加：肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。
2、恶变危险：肛瘘的多发性，可形成直肠瘘、直肠尿道瘘和直肠膀胱瘘，危及周围脏器，并且多年未治或误治的老肛瘘有恶变变的可能。
3、感染流脓：肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓汁刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈。久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，发作亦越频繁，形成互为因果。
4、肛门失禁：任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。
怎么治疗肛周脓肿？
少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式。
（一）单纯性脓肿的治疗
可在截石位或侧卧下，用局麻或腰麻，在脓肿部位做放射状切口，放出脓液后，伸入食指探查脓腔大小，分开其间隔。必要时将切口边缘皮肤切开少许，以利引流，最后用凡士林纱条放入脓腔做引流。
（二）脓腔与肛瘘相通的脓肿
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是脓肿一期治愈，不再形成肛瘘。但在急性炎症中，找内口有困难时，不应盲目寻找，以免炎症蔓延或形成假道，仅做切开排脓，待形成肛瘘后，再做肛瘘手术。二期手术优点是效果准确，治愈率高。