上清丸为常用的清热解毒中成药。平时较为常见的有：上清丸、黄连上清丸、牛黄上清丸、芎菊上清丸等。所谓“上清”，意指“清上焦之热”，临床常用于上呼吸道感染所导致的发热、疼痛。
所有种类的上清丸一般具有的成分为：黄芩、栀子（用于清热）、白芷、防风、荆芥（用于祛风止痛），性偏寒。以水丸剂型居多。一般的上清丸还有大黄、黄柏等成分。
中医理论认为，“三焦”为五脏六腑之一，“三焦”是上焦、中焦、下焦的合称。
上、中、下三焦部位的划分为：
上焦：一般将膈以上的胸部，包括心、肺两脏，以及头面部，称为上焦。中焦：是指膈以下、脐以上的上腹部，包括脾胃和肝胆等脏腑。下焦：一般以脐下的部位为下焦，包括小肠、大肠、肾、膀胱、女子胞、精室等脏腑以及两下肢。三焦的总体功能是通行诸气和运行水液。三焦的病理表现一般为实火之证，需用清热解毒药祛湿泻火。。
上清丸善清上焦之火，具有清热散风，解毒，通便的功效，临床上主要用于头晕耳鸣、目赤、鼻窦炎、口舌生疮，牙龈肿痛，大便秘结。
上清丸经过加减方之后，可具有不同的偏性，使其更为适宜治疗某类疾病。
1、上清丸对感冒所致的轻度发热、咽喉肿痛效果较好。同时由于方中含有大黄等药物，又可清下焦之热，故对小便黄赤、大便秘结等疗效显著。
2、黄连上清丸在上清丸的基础上加黄连、石膏、蔓荆子、旋覆花等，前两者清热能力较强；蔓荆子可疏风、散热、止痛；旋覆花可清痰降气。故适用于上呼吸道感染所致的中重度发热，咽喉、口腔炎症疼痛较甚，而且有咳嗽痰多症状者。
3、牛黄上清丸牛黄上清丸是在黄连上清丸的基础上加牛黄和冰片。牛黄是寒凉之品；冰片具有开窍醒神的作用。故对感冒发热，而且伴有昏沉症状者效果较好。但老年人、便溏者、孕妇不宜服用。
4、芎菊上清丸芎菊上清丸是在上清丸的基础上去大黄、黄柏，加羌活、藁本，具有祛风止痛的作用，故对头痛有效，如偏头痛、三叉神经痛、丛集性头痛、癫痫头痛等。
不同的上清丸具有的共性是：皆属偏寒性药物，可能会影响消化功能，故消化功能不良者（如年老体弱）应慎用。在服药期也应该注意不要食用辛辣刺激的食物。孕妇忌服。
