功能性腹痛综合征（FAPS）是指持续的或经常复发的腹部疼痛，该病症与肠道功能无关，而与内源性疼痛调节系统的改变密切相关，采用当前的诊断方法，不能发现可以解释该病症的结构或代谢异常的一类的综合征引。那么，功能性腹痛的治疗方法有哪些？
一般治疗
确定治疗目标，应向患者讲明，FAPS与慢性关节炎等疾病一样，治疗目标是缓解症状、改善功能。FAPS患者须定期随诊，一般随诊2、3次后，就可建立相互信任的医患关系，此后可延长随诊时间，减为每2～3个月1次。
让患者主动参与治疗；患者主动参与治疗有助于控制病情。让患者记几周病情日记，特别是记录腹痛发生的诱因及腹痛时的情绪反应。这不仅可了解诱发病情加重的因素，有助于发现患者面对腹痛时的反应，也有助于精神科专家选择适当的行为治疗策略。
根据症状的严重程度制定治疗方案；中等度间断腹痛，且腹痛发生与心理应激显然有关的患者，往往对心理治疗的反应良好。也可先给予抗抑郁药（如TCA），患者在接受TCA治疗使腹痛减轻后，便渐渐能够接受心理治疗。
向精神专科医生咨询；患者一般不愿去看精神科医生，因为他们不了解精神治疗的益处，担心这会影响自己的声誉，或者觉得这只是内科医生的推托之词。因此，心理治疗最好作为缓解腹痛和精神压力的辅助治疗，应同时进行药物治疗和心理治疗。
多学科合作治疗疼痛；多学科合作的疼痛治疗模式可为慢性疼痛患者提供综合、合理、有效的康复治疗，有助于缓解难治性慢性疼痛，可帮助患者逐渐摆脱止痛剂。还有一个意想不到的好处是可能会发现原来漏诊的疾病。
药物治疗
抗抑郁药和抗焦虑；抗抑郁药尤其是三环类抗抑郁药（TCA）可同时发挥止痛作用和抗抑郁作用，缓解FAPS患者的疼痛。目前仅有少数临床对照试验，且试验结果尚不一致。与较新的抗抑郁药（如5羟色胺再摄取抑制剂）比较，TCA缓解疼痛更为有效。更新的抗抑郁药5羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂在缓解疼痛方面更为有效。
仅在中重度FAPS患者中应用抗抑郁药。症状高度躯体化的患者若不能耐受常规量抗抑郁药，可先用极小量TCA，逐渐加量，或加用其他药物，或联合心理行为治疗，这是极为必要的。
应告知患者抗抑郁药治疗FAPS的有关知识：①改变脑内神经递质，减轻疼痛感觉；②所用剂量远低于精神疾病的用量；③用药几周后起效；④副作用将逐渐减小。
因长期应用苯二氮类药物可能产生依赖性或成瘾以及有可能降低痛阈、加重症状，不推荐长期服用。 止痛药物；多数止痛剂（如阿司匹林和非类固醇类抗炎药）疗效甚微，可能与药物作用靶点主要在外周有关。
应避免使用麻醉类止痛药，因为其不仅有使患者成瘾的可能，且可能会引起麻醉剂肠病（是指长期使用麻醉剂可导致肠道动力低下，痛觉敏感性增加）。若患者腹痛难以忍受，确实需要麻醉剂，医生应遵循麻醉剂的用药原则用药。
患者若长期服用麻醉剂，医生须向患者建议在几天至几周内逐渐停用，减量速度根据患者所服剂型及对药物的依赖程度来调整，必要时可短期服苯二氮类药物，以控制焦虑。可乐定有助于减轻药物撤退带来的不适症状和疼痛。同时启动包括多种药物和行为治疗的综合治疗计划。
抗惊厥剂；抗惊厥剂对慢性神经痛等慢性疼痛综合征有一定的疗效，且副作用较少，相对比较安全，成瘾性较小，可阻断疼痛和抑郁之间的恶性循环，用来替代TCA。其中研究较多的是加巴喷丁、卡马西平和拉莫三嗪。对一些难治性FAPS患者，可将抗惊厥剂作为一种辅助治疗手段。
其他药物 因为失眠可加重患者疼痛的感觉，打破慢性疼痛和睡眠障碍之间的恶性循环极其有利。药物（镇静类抗抑郁药、安眠药、镇静类抗精神病药）和非药物疗法（控制刺激强度、限制睡眠、肌肉放松训练）均可使用。
心理治疗
认知-行为治疗可帮助患者认识到自己错误的想法、感觉和行为，提高其控制症状的能力，使其学会处理应激事件或焦虑带来的内心巨大压力。如果医生将心理治疗作为辅助治疗方法及一种缓解疼痛、减轻躯体症状带来的不良心理应激的手段，患者就会乐意接受心理治疗。
心理治疗对多数FAPS患者有益，精神科医生的全程参与治疗将有利于心理治疗发挥作用。