位于肾外层的结核结节常是多发性的，大部分能逐渐吸收自行痊愈；亦可呈慢性潜伏状态，直到机体抵抗力降低情况下，泌尿系结核的病灶乘虚而扩大、融合，发生干酪坏死及空洞形成。病变可直接侵袭蔓延或通过淋巴管播散到肾内层，进而与肾盂肾盏相通。此时出现泌尿系症状，称为临床肾结核。但临床肾结核85%为单侧性。一般从初染至临床肾结核，间隔约2～20年，平均8年。因此临床肾结核在婴幼儿甚少见，一组53例肾结核住院病孩中.10岁以上者占60%，笔者曾见一例输尿管结核并不全梗阻患儿年仅2岁。

泌尿系结核的结核性空洞一般在肾乳头处破溃入侵肾盏，干酪坏死物及结核菌在下行过程中，可致肾盂、输尿管、膀胱等产生结核病变。多发性的粘膜溃疡及纤维性变，可致输尿管口径变窄及膀胱挛缩，两者均可致膀胱输尿管反流，进一步加重病肾的破坏。对侧肾输尿管开口处结核可导致该肾积水。同时可发生上行性感染，使对侧肾受犯，但少见。晚期病例全肾充满脓液和干酪样物质，肾被膜破溃后形成周围结核性寒性脓肿。少数病例肾功能逐渐丧失，输尿管闭塞，全肾广泛钙化，混有干酪物质，此时膀胱的继发结核病变反见好转，甚至症状消失，称为“肾白截”，但肾内病灶仍然潜在，并非痊愈。

膀胱结核初期是充血、水肿、散在的黄色结核结节形成，继而融合成片状溃疡、肉芽肿、纤维化。严重的膀胱结核可穿透至阴道或直肠形成瘘道。继发尿道结核可致尿道狭窄排尿困难，但少见。半数患者可并发生殖系结核，附睾结核最为多见。

泌尿系结核可并发非特异性感染。

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