慢性肺脓肿一般是由急性肺脓肿发展而来，由于病情的拖延或是用药不当引起的，慢性肺脓肿的临床表现不明显，需要依赖各种检查仪器和手段。因为这个特性，其诊断和治疗的难度也相对较高，患者需要做好心理准备，并且积极配合医务人员的工作。
体征
慢性肺脓肿大多有急性肺脓肿的临床表现，例如开始畏寒、高热（体温可高达39～40℃）、咳嗽、咳黏液痰或黏液脓痰。如炎症波及胸膜，有胸痛。病变范围广的，中毒症状重，呈全身衰弱，有气短、心跳快、出汗、食欲减退。1～2周后脓肿破入支气管，突然咳出大量脓痰，1天可多达数百毫升，因有厌氧菌感菌感染，痰有臭味，静置后分为3层，由上而下为泡沫、黏液及脓渣。脓排出后，全身症状好转，体温下降等。
体检发现患侧局部胸廓塌陷，肋间隙变窄，呼吸运动减弱，叩诊呈浊音，语颤增强，呼吸音减低或出现啰音，多数患者合并杵状指趾。
但是慢性肺脓肿的症状时轻时重，主要是咳嗽、咳脓痰，不少有咯血，从痰带血至大咯血，间断发热及胸痛等。因长期慢性中毒及消耗，不少患者出现消瘦、贫血。个别有脑、肝、肾转移脓肿。慢性脓肿常有不规则治疗史，病变稳定时情况稍好转。可有精神萎靡，营养不良，体重减轻的表现。
慢性肺脓肿由于胸膜粘连，粘连中形成侧支循环，血流方向是自血压较高的胸壁体循环流向血压较低的肺循环。临床在其体表部可听到收缩期加重的连续性血管杂音。
血液检查
急性的肺脓肿白细胞会明显增多，但是慢性肺脓肿患者的白细胞无明显改变，但可有轻度贫血。
X光线
主要呈空洞病变，多有液平。内外壁界限清楚，并有较长的纤维索条通向四周。同时有肺部慢性炎症、新的播散病灶、肺部纤维化或团块状致密阴影。并发脓胸、脓气胸。
与一般的肺脓肿相比，肺部的病变速度和病变幅度都比较小。
但是慢性肺脓肿由于是急性肺脓肿发展而成的，诊断难度并不是十分高，但是要准备把握肺脓肿什么时候发展为慢性，却是一件难度很高的事情，一般来说，当肺脓肿的症状反复出现，时好时坏，治疗的时间延长甚至超出正常范围，就可以考虑是不是发展成了慢性的肺脓肿。