白喉的患者有可能出现中毒性心肌炎、神经麻痹等并发症，在治疗的过程中，必须预防和兼顾这些并发症，特别是心肌炎这种容易致命的症状。此外，因为此病的传染性极强，所以治疗期间对于患者对的处理也需要谨慎，对于患者是否治愈的诊断也必须准确，总言之，白喉的治疗必须兼顾其他并发症和注意其传染性强的特性。
心肌炎的治疗
中毒性心肌炎是最常见的白喉并发症，多发生在病程的第2～3周。心电图异常者（心肌损害、传导阻滞等）可达25%左右。
患者应卧床休息，烦躁者给以镇静剂。可用泼尼松口服，症状好转后逐渐减量。严重病人可用三磷酸腺苷（ATP），辅酶A50U，溶于5%～10%葡萄糖溶液50～100ml中做静滴。或是静脉注射葡萄糖加能量合剂和维生素C，肌注B族维生素。严重者可服用肾上腺皮质激素。有心力衰竭时要慎用毒毛旋花子甙K，如出现室性心动过速可给利多卡因（1～2mg，静注）或用普鲁卡因酰胺（0.5～1.0溶于200ml葡萄糖液中）静滴。心律恢复后可停用或改为口服。
神经麻痹的治疗
周围神经麻痹多见于病程第3～4周，主要侵犯颅神经，以舌咽神经受损引起的软腭咽麻痹最为常见。此外，可见眼肌、面肌、四肢远端肌、麻痹，一般可在2-3个月内恢复，不留后遗症。
神经麻痹无特殊治疗方法。可予针刺及大剂量维生素B1、B12注射。软腭及咽麻痹者给予鼻饲，呼吸肌麻痹可用人工呼吸器，吞咽困难者用鼻饲。
喉梗阻的治疗
对轻度喉梗阻者需密切观察病情的发展，随时准备做气管切开。呼吸困难较重，出现三凹症时，应即进行气管切开，并在切开处钳取假膜，或滴入胰蛋白酶或糜蛋白酶以溶解假膜。
中毒性肾病的治疗
关键是要加速白喉杆菌毒素的排出和控制，如药物致急性过敏性间质性肾炎，表现为肾病综合征者，无禁忌证时，可用肾上腺皮质激素，免疫抑制药。肾功能衰竭者可用腹膜透析或血液透析治疗。