一般治疗
1、呼吸道隔离：由于支原体感染可造成小流行，且患儿病后排支原体的时间较长，可达1～2个月之久，婴儿时期仅表现为上呼吸道感染症状。在重复感染后才发生肺炎。同时在感染MP期间容易再感染其他病毒，导致病情加重迁延不愈，因此、对患儿或有密切接触史的小儿、应尽可能做到呼吸道隔离，以防止再感染和交叉感染。
2、护理：应注重休息、护理与饮食。必要时可服小量退热药，及服用中药（参见支气管炎）。保持室内空气新鲜，保持室温在18～20℃，相对湿度在60%为宜，供给易消化、营养丰富的食物及足够的液体。保持口腔卫生及呼吸道通畅，经常给患儿翻身、拍背、变换体位，促进分泌物排出，必要时可适当吸痰，消除黏稠分泌物。
3、氧疗：对病情严重有缺氧表现者，或气道梗阻现象严重者，应及时给氧。方法与一般肺炎相同。
抗菌治疗
临床首选红霉素30～50mg/（kg• d），分4次口服，成人1、5g/d，分3次口服，疗程2～3周。大环内酯类新药，如罗红霉素，胃肠副作用少，体液浓度高，细胞穿透力强，半衰期长，用量小，5mg～10mg/（kg•d），分2次口服。新药阿奇霉素胶囊首剂10mg/（kg•d），以后5mg/（kg•d），一次口服，5天为一疗程。因半衰期长，停药后药效尚可持续1周。也有选用诺氟沙星或环丙沙星每次0、4g，2次/d，疗程5～7天。
治疗用药
能够阻止细胞核蛋白合成的大环内酯类抗生素如红霉素、克拉霉素、阿奇霉素等，是治疗支原体肺炎的首选抗生素，尤其是克拉霉素、阿奇霉素的胃肠道副作用少，疗效好，用药方便。而且这些药物对衣原体感染也很有效，同时可用于治疗大多数常见的下呼吸道感染。 必须强调的是，常用于治疗呼吸道感染和肺炎的青霉素类和头孢菌素类抗生素，其抗菌原理为阻止细胞壁合成。而支原体无细胞壁。因此，这两类药用于支原体肺炎就是“不对路”了。