肾积水首先要查明原因，若是先天性肾盂输尿管连接部狭窄，尽可能选择腹腔镜下肾盂成形术，此手术要求技术较高，需一定设备和手术经验，尽可能就近选择正规三甲医院，若经济一般，可选择开放手术，采用离断性肾盂成形术，手术成功率在90%左右，术后出现炎性狭窄，最好采用记忆合金支架植入术，术后效果不错，此技术主要需要记忆合金支架，此支架用的少，很少有医院开展，故应选择大一点医院，因为他们病源多，需求大，故才有可能准备此物品，此技术要求不是很高，避免二次开放手术。
上段结石引起肾积水，碎石无效，选择经皮肾镜下碎石取石术，能够达到取净结石目的。中断结石，碎石无效，采用腹腔镜下输尿管切开取石术，可以取出结石，但创伤较大，费用较高，经济条件一般，可行开放输尿管切开取石术，治疗效果亦不错，若不愿开放手术，还可采用输尿管镜下碎石术，虽不能达到取石目的，但能够粉碎结石，利于结石排出，缺点，排石时间较长，治疗时间长，有时得结合体外震波碎石治疗。对于下段结石，可采用输尿管镜下碎石术，治疗效果好，费用不是很高，但成功率不是百分之百，若不成功，可采用开放输尿管切开取石术。
若肿瘤引起肾积水，对肾功能良好，可行腹腔镜下肾切除术结合输尿管切除术，膀胱部分切除术，治疗原则同上，根据经济及地利条件选择，若对肾功能不良，或有潜在的影响肾脏功能的疾病，如糖尿病，高血压等疾病，狭窄段较小，可行肿瘤切除输尿管吻合术，采用开放还是腹腔镜，根据自身条件及地利情况选择。若狭窄段较长，切除后无法吻合，尽可能切除肿瘤及输尿管，行肾膀胱皮下分流术，需使用昂贵卫材，并且此管至少半年至一年更换一次，更换过程简单，但费用较高。
若是炎性狭窄，治疗同肾盂输尿管连接部狭窄。输尿管反流引起肾积水，一般多为下尿路梗阻引起，解决下尿路梗阻即可，如前列腺增生，行经尿道前列腺切除术，尿道狭窄行尿道扩张术。输尿管末端囊肿引起，行切开术，先天性，行输尿管再植术，膀胱全切，肠代膀胱术，术后出现肾积水，多是吻合口狭窄引起，可在经皮肾镜下行内DJ管植入术，需定期更换此管，较麻烦痛苦，费用较高。
